60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3966 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
130 aa  255  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  77.12 
 
 
124 aa  183  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  53.97 
 
 
136 aa  126  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  57.02 
 
 
121 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  56.73 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  50.94 
 
 
115 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  50.94 
 
 
115 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  45.19 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  47.47 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  45.79 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  48.39 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  45.16 
 
 
121 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  41.28 
 
 
117 aa  87  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  48.18 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  43.24 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  43.7 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  43.12 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  45.1 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  46.43 
 
 
115 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  53.49 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  43.81 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  38.53 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  50.52 
 
 
139 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  56.58 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  50 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  46.81 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  39.25 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  40.74 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  50 
 
 
128 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  44.68 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  43.27 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  57.89 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  39.74 
 
 
107 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  51.9 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  37.5 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  49.4 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  52.63 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  43.4 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  44.58 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  43.14 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  29.41 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  25.86 
 
 
128 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  46.34 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  29.25 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>