More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3844 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  73.03 
 
 
483 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  72.41 
 
 
483 aa  702    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  79.83 
 
 
481 aa  747    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  75.31 
 
 
483 aa  732    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  72.82 
 
 
483 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  691    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  75.99 
 
 
484 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 
483 aa  946    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  73.24 
 
 
483 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  75.99 
 
 
484 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  73.24 
 
 
483 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  73.03 
 
 
483 aa  688    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  85.3 
 
 
483 aa  763    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  72.2 
 
 
483 aa  689    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  85.3 
 
 
483 aa  762    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  88.8 
 
 
483 aa  828    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  75.99 
 
 
484 aa  721    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  57.93 
 
 
480 aa  543  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  53.86 
 
 
492 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  50.73 
 
 
495 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  50.84 
 
 
494 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  47.23 
 
 
477 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  47.02 
 
 
477 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  46.81 
 
 
477 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  46.23 
 
 
479 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  47.02 
 
 
477 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  45.82 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  46.58 
 
 
487 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  42.58 
 
 
482 aa  410  1e-113  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  46.87 
 
 
477 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  43.88 
 
 
479 aa  364  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  43.25 
 
 
481 aa  363  3e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  44.37 
 
 
483 aa  362  8e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  38.92 
 
 
512 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  37.29 
 
 
496 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  38.85 
 
 
540 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  31.69 
 
 
444 aa  233  5e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.67 
 
 
504 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.24 
 
 
492 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  27.69 
 
 
492 aa  148  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.54 
 
 
533 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  26.35 
 
 
487 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.16 
 
 
492 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.56 
 
 
492 aa  144  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  26.14 
 
 
529 aa  143  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  26.39 
 
 
493 aa  143  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.56 
 
 
492 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.75 
 
 
482 aa  143  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  26.39 
 
 
493 aa  143  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  26.39 
 
 
493 aa  143  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.16 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.37 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.16 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.37 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.16 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.77 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.31 
 
 
492 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.16 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.71 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  27.52 
 
 
513 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  27 
 
 
492 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.52 
 
 
518 aa  136  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  26.98 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25.41 
 
 
544 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.8 
 
 
493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.93 
 
 
504 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.22 
 
 
491 aa  133  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  23.51 
 
 
488 aa  133  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  27.46 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  26.61 
 
 
499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.58 
 
 
500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  26.67 
 
 
528 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.77 
 
 
533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  28.25 
 
 
493 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.67 
 
 
485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.41 
 
 
492 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  26.88 
 
 
484 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.81 
 
 
533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  26.51 
 
 
495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  27.45 
 
 
497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.5 
 
 
488 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  26.67 
 
 
512 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  26.67 
 
 
512 aa  129  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  25 
 
 
489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  26.48 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  27.05 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  24.68 
 
 
486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  27.27 
 
 
498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>