46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3752 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
153 aa  313  7e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  64.71 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  64.71 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  60.53 
 
 
155 aa  191  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  59.21 
 
 
155 aa  186  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  53.95 
 
 
157 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  48.95 
 
 
153 aa  148  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  46.85 
 
 
154 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  46.85 
 
 
154 aa  141  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  42.96 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  41.55 
 
 
150 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  42.96 
 
 
157 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  42.38 
 
 
153 aa  120  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  40.85 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  57.61 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  37.76 
 
 
149 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  46.08 
 
 
109 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  45.28 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  37.8 
 
 
184 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  42 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  36.13 
 
 
170 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  41.51 
 
 
157 aa  87.4  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  41.6 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  36.8 
 
 
152 aa  84  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  40.15 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  37.25 
 
 
174 aa  82  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  39.45 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  38.74 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  39.77 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  43.18 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  42.35 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  40.37 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  46.84 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  37.08 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  33.75 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  31.37 
 
 
141 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  28.3 
 
 
127 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  36.99 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  30.6 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  30.67 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  27.72 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  32.26 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  35.45 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>