41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3751 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3751  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  351  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4152  hypothetical protein  57.06 
 
 
191 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682619  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4163  hypothetical protein  56.73 
 
 
191 aa  211  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0941448  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2638  hypothetical protein  58.79 
 
 
190 aa  207  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.254409  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1266  hypothetical protein  52.94 
 
 
191 aa  204  4e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2343  hypothetical protein  52.94 
 
 
191 aa  204  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000144588  unclonable  0.000000152413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1613  hypothetical protein  58.18 
 
 
190 aa  201  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0694  hypothetical protein  53.94 
 
 
189 aa  199  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0775064  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0233  hypothetical protein  56.97 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3463  hypothetical protein  55.56 
 
 
189 aa  195  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4436  hypothetical protein  49.4 
 
 
189 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.713232  normal  0.574108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3384  hypothetical protein  48.8 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1505  hypothetical protein  47.59 
 
 
194 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00633396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3977  hypothetical protein  47.59 
 
 
191 aa  160  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.278449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4762  hypothetical protein  47.59 
 
 
191 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3278  hypothetical protein  41.46 
 
 
192 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.423903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3977  hypothetical protein  47.97 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.289017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1953  hypothetical protein  39.58 
 
 
197 aa  104  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  0.0485673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1636  hypothetical protein  44.23 
 
 
186 aa  104  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1857  hypothetical protein  42.48 
 
 
181 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1772  hypothetical protein  38.75 
 
 
179 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4423  hypothetical protein  34.32 
 
 
196 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151908  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2688  hypothetical protein  37.34 
 
 
179 aa  99  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2648  hypothetical protein  38.24 
 
 
180 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.3572  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1305  hypothetical protein  38.24 
 
 
180 aa  94  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.524711  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0888  hypothetical protein  35.34 
 
 
179 aa  90.5  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1184  hypothetical protein  36.18 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.430255  normal  0.82383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03460  hypothetical protein  36.99 
 
 
190 aa  88.2  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.410158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0337  hypothetical protein  33.73 
 
 
196 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0847  hypothetical protein  37.14 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8411  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8220  hypothetical protein  28.3 
 
 
192 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3923  hypothetical protein  32.75 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.835574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1588  hypothetical protein  29.24 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0803  hypothetical protein  24.39 
 
 
208 aa  61.6  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.806427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0073  hypothetical protein  30.52 
 
 
196 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13781  hypothetical protein  60.47 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.338899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2631  PilT domain-containing protein  43.14 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.996452  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1415  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4601  PilT protein domain protein  37.25 
 
 
152 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0345654  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4670  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  40.8  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>