More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3747 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  100 
 
 		 302 aa  603  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  60.41 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  60.07 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4282  homocysteine S-methyltransferase  59.12 
 
 		 309 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4837  homocysteine S-methyltransferase  61.15 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.345042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2776  homocysteine S-methyltransferase family protein  60.76 
 
 		 307 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  58.72 
 
 		 308 aa  328  7e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5121  homocysteine S-methyltransferase  59 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0135376  normal  0.478948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6804  homocysteine S-methyltransferase  60 
 
 		 313 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0975  homocysteine S-methyltransferase  58.98 
 
 		 310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000866621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1135  homocysteine S-methyltransferase family protein  59.32 
 
 		 298 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.300332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2930  homocysteine S-methyltransferase  51 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  56.21 
 
 		 300 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3865  homocysteine S-methyltransferase  56.55 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  53 
 
 		 310 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3243  homocysteine S-methyltransferase  55.17 
 
 		 300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.562987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5017  S-methyltransferase  52.35 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4534  homocysteine S-methyltransferase  53.54 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0770365 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6392  homocysteine S-methyltransferase  50.85 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.612657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3090  homocysteine S-methyltransferase  56.21 
 
 		 300 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3100  homocysteine S-methyltransferase  56.21 
 
 		 300 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05821  homocysteine S-methyltransferase  47.97 
 
 		 301 aa  278  9e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  48.14 
 
 		 310 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  47.71 
 
 		 305 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48307  predicted protein  39.75 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532238  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  38.33 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  37.58 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  33.77 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3928  homocysteine S-methyltransferase  38.28 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.45742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  30.96 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  31.33 
 
 		 325 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  32.81 
 
 		 311 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  30.82 
 
 		 302 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2200  homocysteine S-methyltransferase  32.12 
 
 		 307 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.558388  normal  0.514236 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  29.87 
 
 		 311 aa  89  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  28.43 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.36 
 
 		 351 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1947  methionine synthase  28.35 
 
 		 1223 aa  85.5  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0537124  normal  0.960844 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  30.91 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0772  homocysteine S-methyltransferase  24.28 
 
 		 780 aa  85.1  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0538889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  27.19 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2207  homocysteine S-methyltransferase  27.6 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  30.77 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.27 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0156  homocysteine S-methyltransferase  26.97 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0149  homocysteine S-methyltransferase  27.05 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  27.24 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  27.56 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  28.43 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  30.89 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1138  methionine synthase  27.38 
 
 		 1215 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537288  normal  0.145457 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  30.06 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  27.44 
 
 		 314 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  29.38 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  31.06 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2169  methionine synthase  26.59 
 
 		 1245 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.205577  normal  0.226732 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6259  methionine synthase (B12-dependent)  27.16 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.88 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  26.95 
 
 		 1238 aa  76.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002355  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  24.93 
 
 		 1226 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3690  B12-dependent methionine synthase  27.91 
 
 		 1220 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.62 
 
 		 609 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0115  homocysteine S-methyltransferase  26.52 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.165107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0169  homocysteine S-methyltransferase  25.51 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3632  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  26.67 
 
 		 617 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3268  homocysteine S-methyltransferase  25.53 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0358  homocysteine S-methyltransferase, putative  27.44 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4240  methionine synthase (B12-dependent)  28.01 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.826519  normal  0.408833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2132  B12-dependent methionine synthase  27.46 
 
 		 1245 aa  74.3  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638146 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0477  homocysteine S-methyltransferase  28.44 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0783224 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4332  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.63 
 
 		 1132 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0434  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.808444  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0595  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3218  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1345  B12-dependent homocysteine-N5-methyltetrahydrofolate transmethylase, repressor of metE and metF  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.185494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0249  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.481246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0414  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.74 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2302  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine S-methyltransferase  26.87 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2828  homocysteine S-methyltransferase  27.71 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  30.55 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2965  methionine synthase  27.71 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2916  methionine synthase  26.87 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142976  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0283  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.69 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2931  homocysteine S-methyltransferase  26.87 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  26.79 
 
 		 1232 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  27.13 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3995  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.32 
 
 		 1133 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4274  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.32 
 
 		 1132 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4005  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25.32 
 
 		 1133 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.04 
 
 		 1263 aa  72.8  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4385  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25 
 
 		 1132 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4156  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25 
 
 		 1132 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1268  homocysteine S-methyltransferase  25 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.897971 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3775  B12-dependent methionine synthase  24.78 
 
 		 1227 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4478  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  25 
 
 		 1132 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.08 
 
 		 605 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0388  homocysteine S-methyltransferase  27.41 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0207088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  25.38 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5287  methionine synthase  26.36 
 
 		 1266 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3951  B12-dependent methionine synthase  24.27 
 
 		 1227 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.360627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>