22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3728 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3728  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  969    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2665  hypothetical protein  29.91 
 
 
488 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0746  hypothetical protein  25.81 
 
 
465 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0647  hypothetical protein  25.98 
 
 
465 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.248292  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4757  protein of unknown function DUF900 hydrolase family protein  26.47 
 
 
1081 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06268  DUF726 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12860)  25.71 
 
 
873 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03360  hypothetical protein  24.38 
 
 
256 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000516345  unclonable  5.57606e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0398298  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.503351  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
237 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0202252  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0010  hypothetical protein  26.63 
 
 
237 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00011  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00011  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0011  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0010  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.642715  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0011  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0012  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.242726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3585  protein of unknown function UPF0174  25.58 
 
 
237 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3644  hypothetical protein  25.58 
 
 
237 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0012  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4801  hypothetical protein  22.82 
 
 
273 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.472026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>