More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3630 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4734  extracellular solute-binding protein  61.52 
 
 		 521 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3630  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 514 aa  1065    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3507  extracellular solute-binding protein family 5  86.96 
 
 		 510 aa  943    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3824  extracellular solute-binding protein  55.1 
 
 		 524 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4381  extracellular solute-binding protein  59.5 
 
 		 510 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.582693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2974  extracellular solute-binding protein  57.92 
 
 		 530 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3653  extracellular solute-binding protein family 5  58.54 
 
 		 513 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0310608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2267  extracellular solute-binding protein  55.14 
 
 		 506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.347756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2576  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  54.74 
 
 		 506 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3603  extracellular solute-binding protein  44.16 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3112  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.817588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 505 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.79 
 
 		 520 aa  174  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 		 532 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.11 
 
 		 525 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4426  extracellular solute-binding protein  29.36 
 
 		 520 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4455  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.661138  hitchhiker  0.000234808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.73 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  29.86 
 
 		 527 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  27.49 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1113  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.25 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.322522  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  27.61 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.75 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 530 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3804  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 509 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00625229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.66 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  28.75 
 
 		 520 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.54 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.06 
 
 		 520 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.28 
 
 		 521 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  24.28 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.28 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  24.28 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 521 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.22 
 
 		 520 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 538 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  28.9 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 528 aa  150  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 530 aa  149  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  26.02 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1768  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0975  putative dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.124849  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0324  putative ABC transporter substrate-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  27.43 
 
 		 522 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1324  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1853  putative binding protein YliB  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  30.54 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0238  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0402  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1359  putative glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein  28.16 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.442837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2758  extracellular solute-binding protein family 5  24.52 
 
 		 524 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  27.29 
 
 		 528 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  28.36 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  28.36 
 
 		 512 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 528 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  29.4 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3353  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 520 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  28.14 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  28.14 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  29.58 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  28.14 
 
 		 512 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 		 533 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 526 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  26.53 
 
 		 565 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3431  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 531 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7174  peptide ABC transporter substrate-binding protein  27.34 
 
 		 503 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1551  extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 512 aa  144  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0722  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 522 aa  143  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.597639 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 526 aa  143  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 531 aa  143  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 495 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1491  extracellular solute-binding protein family 5  28.67 
 
 		 514 aa  143  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.93 
 
 		 542 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.97 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.42 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  27.86 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2974  extracellular solute-binding protein family 5  28.31 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7328  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  27.22 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.399444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  28.51 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.67 
 
 		 520 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.72 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.72 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  28.72 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0510  extracellular solute-binding protein  27.02 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0306064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>