More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3494 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
323 aa  661  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  76.01 
 
 
325 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  60.87 
 
 
323 aa  398  1e-110  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  60.99 
 
 
323 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  62.58 
 
 
321 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  46.83 
 
 
345 aa  268  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  40 
 
 
342 aa  255  7e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  42.76 
 
 
320 aa  234  1e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  39.09 
 
 
312 aa  228  1e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  39.26 
 
 
323 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  42.91 
 
 
305 aa  225  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  36.1 
 
 
366 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  37.07 
 
 
380 aa  223  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  35.74 
 
 
348 aa  219  7e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  36.62 
 
 
360 aa  214  1e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  42.52 
 
 
297 aa  213  5e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  41.46 
 
 
325 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  35.5 
 
 
350 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  34.8 
 
 
358 aa  209  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  44.44 
 
 
308 aa  207  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  39.25 
 
 
381 aa  202  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  42.97 
 
 
308 aa  200  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.75168e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.13 
 
 
363 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  32.79 
 
 
361 aa  180  3e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  38 
 
 
371 aa  173  3e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  33 
 
 
343 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  32.71 
 
 
353 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  28.8 
 
 
330 aa  168  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.59 
 
 
313 aa  167  3e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  37.6 
 
 
308 aa  167  3e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  32.14 
 
 
339 aa  164  1e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.45 
 
 
306 aa  164  2e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  36.57 
 
 
326 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 
386 aa  160  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 
346 aa  153  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  31.79 
 
 
339 aa  152  9e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 
316 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  36.21 
 
 
379 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  31.31 
 
 
351 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  30.84 
 
 
338 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
339 aa  148  1e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.74 
 
 
350 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  35.71 
 
 
320 aa  143  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  32.18 
 
 
350 aa  142  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.15 
 
 
336 aa  141  1e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29 
 
 
328 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  31 
 
 
317 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  34.11 
 
 
340 aa  139  8e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  29.43 
 
 
309 aa  139  9e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.1 
 
 
336 aa  137  3e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.46 
 
 
369 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  31.82 
 
 
417 aa  132  1e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  26.57 
 
 
335 aa  131  2e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.2 
 
 
341 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  29.97 
 
 
348 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  28.24 
 
 
355 aa  129  8e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
329 aa  128  1e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.79 
 
 
337 aa  127  2e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.59 
 
 
336 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  28.86 
 
 
331 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 
346 aa  126  4e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.99 
 
 
346 aa  126  4e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  30.8 
 
 
362 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.06 
 
 
315 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.52 
 
 
332 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.14 
 
 
349 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.96 
 
 
343 aa  122  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.8 
 
 
361 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.27 
 
 
349 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.06 
 
 
338 aa  121  2e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.71 
 
 
389 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.03 
 
 
359 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.72 
 
 
367 aa  119  8e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.03 
 
 
331 aa  119  8e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  3.84441e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.03 
 
 
345 aa  119  8e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.14 
 
 
308 aa  118  1e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  31.94 
 
 
344 aa  117  2e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  31.78 
 
 
344 aa  118  2e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.88 
 
 
349 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.09 
 
 
370 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  30.77 
 
 
362 aa  116  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.23 
 
 
326 aa  115  7e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  31.68 
 
 
310 aa  115  9e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.37 
 
 
336 aa  115  1e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 
349 aa  115  1e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.85 
 
 
343 aa  115  1e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  29.89 
 
 
343 aa  115  1e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.05 
 
 
341 aa  115  1e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  30.36 
 
 
345 aa  114  2e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 
331 aa  114  2e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  28.94 
 
 
344 aa  114  2e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  26.91 
 
 
374 aa  114  2e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0955  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.93 
 
 
345 aa  114  2e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  25.09 
 
 
353 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  28.04 
 
 
337 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.02 
 
 
351 aa  113  4e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2757  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.52 
 
 
348 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 
349 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.02 
 
 
351 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  26.02 
 
 
351 aa  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>