86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3477 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 314 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  77.49 
 
 		 320 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  77.17 
 
 		 320 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.36 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  74.42 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  72.82 
 
 		 312 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  74.42 
 
 		 328 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  72.43 
 
 		 334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  72.58 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  74.19 
 
 		 321 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  73.55 
 
 		 321 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  72.9 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  72.9 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  72.9 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  72.9 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  73.55 
 
 		 321 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  47.73 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  42.16 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  43.15 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  42.47 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  40.91 
 
 		 324 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  40.91 
 
 		 324 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  40.26 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  40.33 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  36.75 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  41.14 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  37.92 
 
 		 311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  37.38 
 
 		 312 aa  181  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  31.19 
 
 		 329 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  31.08 
 
 		 349 aa  135  9e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  31.31 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.54 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  30.41 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  30.41 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  30.41 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  29.58 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  28.62 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  28.52 
 
 		 325 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  31.21 
 
 		 320 aa  109  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  28.43 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  29.11 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.32 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.64 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  25.84 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  26.07 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.09 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  26.05 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  25.7 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  25.7 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  33.56 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.23 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  27.27 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  24.43 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  27.27 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  27.94 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1146  hypothetical protein  23.08 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00200161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.1 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  23.05 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.45 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25.58 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  23.17 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.02 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.77 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.55 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0057  hypothetical protein  23.87 
 
 		 303 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  23.79 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  27.12 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25.85 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.22 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.79 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 310 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  26.98 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  26.55 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  28.22 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>