More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3434 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 		 218 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  60 
 
 		 213 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  58.26 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  52.53 
 
 		 211 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4362  lysine exporter protein LysE/YggA  53.46 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.19 
 
 		 218 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2589  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  47.33 
 
 		 243 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.72 
 
 		 218 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  46.26 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  43.93 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  44.75 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0153  LysE family translocator protein  45.91 
 
 		 211 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  47.66 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  49.31 
 
 		 213 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  45.79 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  47.44 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0577  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.12 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0130  LysE family protein  45 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  42.59 
 
 		 213 aa  161  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  42.59 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0037  lysine exporter protein LysE/YggA  41.67 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0776  lysine exporter protein LysE/YggA  54.63 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3141  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514565  normal  0.554318 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3063  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2511  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3125  lysine exporter protein LysE/YggA  41.2 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3180  lysine exporter protein LysE/YggA  40.74 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.920743  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0969  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  51.87 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0311  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.13 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4414  amino acid efflux pump, RhtB family protein  42.13 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.897061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  39.81 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.2 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  43.5 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 208 aa  144  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  40.28 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  42.5 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  40.72 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  42 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  40.55 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.55 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  37.02 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  40.55 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0584  lysine exporter protein LysE/YggA  42.86 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  40.93 
 
 		 208 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  43.9 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0024  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.25 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.35 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0798  lysine exporter protein LysE/YggA  38.32 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  40.65 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.83 
 
 		 206 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4686  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.07 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  41.98 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3077  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.07 
 
 		 206 aa  131  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  36.55 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0914  amino acid efflux protein, putative  35.35 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  36.53 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  42.68 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2266  lysine exporter protein LysE/YggA  36.45 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228935  hitchhiker  0.000000285135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  42.07 
 
 		 207 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0334  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6113  lysine exporter protein LysE/YggA  34.29 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.238794 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1808  lysine exporter protein LysE/YggA  38.07 
 
 		 207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.702237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  35 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.74 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1992  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 		 206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  40.87 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1886  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  40.3 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259351  normal  0.142425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  45.81 
 
 		 209 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2783  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407704  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2794  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.31715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.28 
 
 		 208 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8095  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  42.38 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4206  lysine exporter protein LysE/YggA  40.64 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158668 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0494  LysE family protein  35.24 
 
 		 204 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.515429  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.07 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  37.82 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0929  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.41 
 
 		 209 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0589  LysE family translocator protein  35.24 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.327685  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0774  LysE type translocator  35.24 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2701  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2843  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  36.06 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2583  hypothetical protein  37.27 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258371  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  33.81 
 
 		 204 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0605  LysE family translocator protein  35.24 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0784  amino acid efflux/transport protein  36.02 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1147  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.27 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>