More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3324 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  56.98 
 
 
274 aa  304  1e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  56.98 
 
 
274 aa  303  2e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  56.98 
 
 
274 aa  303  2e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.55 
 
 
274 aa  299  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  57.36 
 
 
285 aa  296  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.09 
 
 
275 aa  286  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.84 
 
 
272 aa  281  7e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 
283 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  52.65 
 
 
274 aa  273  2e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.56 
 
 
272 aa  269  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
272 aa  268  9e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 
273 aa  261  9e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0135056  normal  0.0706675 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0057  short chain dehydrogenase  45.35 
 
 
287 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.551816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
268 aa  250  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  46.99 
 
 
303 aa  249  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6368  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 
279 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  45.72 
 
 
282 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2331  short chain dehydrogenase  48.13 
 
 
285 aa  219  4e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  43.22 
 
 
286 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.76 
 
 
292 aa  216  3e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  44.65 
 
 
280 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 
280 aa  212  5e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  43.75 
 
 
279 aa  212  5e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.12 
 
 
281 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299534  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
280 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
293 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
278 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
295 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
280 aa  204  9e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.16 
 
 
279 aa  200  2e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
274 aa  200  2e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
282 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.73 
 
 
276 aa  197  1e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  39.78 
 
 
280 aa  197  1e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
287 aa  197  2e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  39.11 
 
 
284 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
286 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  43.15 
 
 
847 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 
278 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 
282 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0885  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
305 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.79 
 
 
282 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 
284 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
290 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
279 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
279 aa  189  6e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  8.68521e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  41.63 
 
 
847 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  41.29 
 
 
275 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 
279 aa  187  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
279 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
275 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
282 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
279 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
276 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
277 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1177  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.32 
 
 
288 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  40.6 
 
 
284 aa  184  1e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 
274 aa  183  2e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
282 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
276 aa  182  4e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
285 aa  182  5e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1178  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.72 
 
 
286 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.41 
 
 
285 aa  181  8e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.38 
 
 
284 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 
280 aa  179  3e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
280 aa  179  3e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
282 aa  180  3e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 
273 aa  178  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.01823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
281 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.22 
 
 
296 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3278  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
276 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.82 
 
 
283 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
283 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.406068  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
291 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
291 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
281 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.78 
 
 
291 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
293 aa  173  2e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.426918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.81 
 
 
293 aa  173  3e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.935944  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.21 
 
 
275 aa  173  3e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
276 aa  172  4e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
283 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366194  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1950  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
284 aa  172  6e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417893  normal  0.0791039 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 
291 aa  172  7e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
283 aa  172  8e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
291 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
279 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  38.93 
 
 
266 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0757  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.69 
 
 
282 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0227485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 
281 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
280 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  35.64 
 
 
278 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 
282 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
281 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.966352 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
285 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.239273 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
275 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
289 aa  168  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
277 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal  0.205798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
279 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>