More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3274 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  100 
 
 
465 aa  943  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  68.51 
 
 
480 aa  643  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 
442 aa  516  1e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  57.08 
 
 
449 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.06 
 
 
455 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  58.55 
 
 
456 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  56.65 
 
 
449 aa  508  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.65 
 
 
449 aa  507  1e-142  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
445 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  44.62 
 
 
412 aa  234  4e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  43.09 
 
 
381 aa  233  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
459 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.91 
 
 
452 aa  217  3e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 
420 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
421 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
419 aa  214  3e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  41.28 
 
 
416 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 
429 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.21 
 
 
389 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  31.25 
 
 
429 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  32.08 
 
 
453 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
467 aa  199  1e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
433 aa  197  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
423 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.19 
 
 
365 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  36.93 
 
 
458 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 
449 aa  191  3e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  29.54 
 
 
455 aa  191  3e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  28.33 
 
 
455 aa  191  3e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
454 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.87 
 
 
465 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.05 
 
 
453 aa  190  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
458 aa  190  6e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.15 
 
 
458 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  39.72 
 
 
472 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 
449 aa  186  7e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
449 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
469 aa  184  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  33.92 
 
 
458 aa  184  4e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  30.21 
 
 
449 aa  182  9e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
435 aa  182  9e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
446 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
459 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  34.97 
 
 
458 aa  181  3e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
446 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  5.01512e-05  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.21 
 
 
439 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
449 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 
446 aa  176  1e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  1.82562e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
455 aa  175  2e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  31.51 
 
 
446 aa  174  2e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
455 aa  174  3e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.81 
 
 
362 aa  172  8e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
446 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  3.35712e-10 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
440 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  34.63 
 
 
462 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
446 aa  170  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  33.12 
 
 
457 aa  167  3e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  33.01 
 
 
457 aa  166  6e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.01 
 
 
471 aa  165  2e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
444 aa  165  2e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
570 aa  165  2e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
454 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  36.17 
 
 
449 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
471 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  36.88 
 
 
450 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
466 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
445 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  37.87 
 
 
445 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
448 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
450 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  34.02 
 
 
446 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
457 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  36.67 
 
 
445 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  37.04 
 
 
446 aa  154  3e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  34.93 
 
 
464 aa  154  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  37.13 
 
 
445 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0135  two-component sensor protein  37.36 
 
 
456 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  36.96 
 
 
456 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  34.07 
 
 
462 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  3.59419e-12 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  35.16 
 
 
464 aa  152  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0127  two-component sensor protein  37 
 
 
456 aa  152  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.581229  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  31.86 
 
 
461 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  33.22 
 
 
468 aa  149  2e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
449 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4811  two-component sensor protein  36.53 
 
 
457 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201451 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  33.88 
 
 
468 aa  147  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4304  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.335985  hitchhiker  0.00831139 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4142  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
554 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00056793  hitchhiker  1.60297e-07 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4445  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4106  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4034  two-component sensor protein  35.4 
 
 
456 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5366  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.135229  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 
471 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4073  histidine kinase  35.14 
 
 
457 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4391  two-component sensor protein  35.14 
 
 
457 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1829  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
443 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.957037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
472 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03746  hypothetical protein  34.78 
 
 
457 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.228988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03797  two-component sensor protein  34.78 
 
 
457 aa  143  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>