More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3087 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3087  thiamine monophosphate kinase  100 
 
 
324 aa  654    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2896  thiamine monophosphate kinase  82.1 
 
 
324 aa  542  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  77.02 
 
 
326 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  75.47 
 
 
327 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  76.09 
 
 
326 aa  500  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00365  thiamine monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.532124  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3192  thiamine-monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00369  hypothetical protein  75.16 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.381421  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0338  thiamine monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0499  thiamine monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0448  thiamine monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0453  thiamine monophosphate kinase  74.84 
 
 
325 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3216  thiamine monophosphate kinase  75.16 
 
 
325 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3255  thiamine monophosphate kinase  74.53 
 
 
329 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.05609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3166  thiamine monophosphate kinase  74.22 
 
 
329 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0488  thiamine monophosphate kinase  74.84 
 
 
325 aa  488  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3114  thiamine monophosphate kinase  74.22 
 
 
329 aa  489  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0521  thiamine monophosphate kinase  74.61 
 
 
326 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0479  thiamine monophosphate kinase  73.29 
 
 
325 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0460  thiamine monophosphate kinase  74.61 
 
 
326 aa  484  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0466  thiamine monophosphate kinase  74.61 
 
 
326 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0458  thiamine monophosphate kinase  74.61 
 
 
326 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.703911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0885  thiamine monophosphate kinase  72.05 
 
 
323 aa  474  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0604  thiamine monophosphate kinase  62.11 
 
 
325 aa  429  1e-119  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0648083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  58.18 
 
 
318 aa  370  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  54.09 
 
 
323 aa  352  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  54.09 
 
 
323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  54.09 
 
 
323 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  53.77 
 
 
323 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  54.09 
 
 
323 aa  349  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  53.14 
 
 
318 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  53.14 
 
 
318 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01423  thiamine monophosphate kinase  52.19 
 
 
321 aa  343  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.281467  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  55.03 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  53.14 
 
 
318 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  52.98 
 
 
319 aa  340  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1856  thiamine monophosphate kinase  53.05 
 
 
334 aa  340  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0710389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  52.83 
 
 
318 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0832  thiamine-monophosphate kinase  52.23 
 
 
335 aa  338  5e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000411831  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  53.77 
 
 
319 aa  338  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  52.52 
 
 
319 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  53.87 
 
 
333 aa  335  5e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  52.2 
 
 
323 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01171  thiamine monophosphate kinase  52.01 
 
 
321 aa  325  4.0000000000000003e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1316  thiamine-monophosphate kinase  50.94 
 
 
336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004260  thiamine-monophosphate kinase  52.01 
 
 
321 aa  318  9e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0240227  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1533  thiamine-monophosphate kinase  49.38 
 
 
320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0750268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0927  thiamine-monophosphate kinase  47.08 
 
 
330 aa  299  4e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.93501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2241  thiamine-monophosphate kinase  45.99 
 
 
335 aa  271  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  42.55 
 
 
320 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  42.55 
 
 
320 aa  266  4e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  47.27 
 
 
331 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1564  thiamine-monophosphate kinase  49.22 
 
 
315 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0804  thiamine-monophosphate kinase  45.6 
 
 
319 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.914964  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0765  thiamine-monophosphate kinase  47.06 
 
 
318 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0794  thiamine-monophosphate kinase  51.3 
 
 
318 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  46.36 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  47.39 
 
 
332 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3852  thiamine monophosphate kinase  47.04 
 
 
317 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  46.95 
 
 
326 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1653  thiamine-monophosphate kinase  45.77 
 
 
325 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0108412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  44.1 
 
 
316 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0380  thiamine-monophosphate kinase  47.81 
 
 
321 aa  246  4e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.450658  normal  0.175688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2193  thiamine-monophosphate kinase  44.55 
 
 
317 aa  245  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00454297  hitchhiker  0.00000617808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  46.93 
 
 
324 aa  245  6e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  46.44 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3740  thiamine-monophosphate kinase  44.98 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3919  thiamine-monophosphate kinase  44.71 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  44.82 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0487  thiamine-monophosphate kinase  47.27 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  46.01 
 
 
324 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0519  thiamine monophosphate kinase  46.04 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  45.45 
 
 
332 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  46.5 
 
 
333 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5014  thiamine monophosphate kinase  44.89 
 
 
321 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  46.42 
 
 
324 aa  241  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0013  thiamine-monophosphate kinase  42.94 
 
 
341 aa  239  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0554  thiamine monophosphate kinase  50.55 
 
 
322 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1188  thiamine monophosphate kinase  45.09 
 
 
333 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  43.38 
 
 
325 aa  238  9e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  46.06 
 
 
332 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  46.06 
 
 
332 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  46.06 
 
 
332 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0565  thiamine monophosphate kinase  45.4 
 
 
322 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  45.92 
 
 
332 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0572  thiamine monophosphate kinase  46.58 
 
 
319 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  46.22 
 
 
332 aa  235  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0585  thiamine monophosphate kinase  46.63 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1050  thiamine monophosphate kinase  44.58 
 
 
322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3665  thiamine-monophosphate kinase  45.97 
 
 
332 aa  232  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0695  thiamine monophosphate kinase  46.27 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0573  thiamine-monophosphate kinase  42.77 
 
 
318 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.929555  normal  0.0493584 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1903  thiamine monophosphate kinase  44.1 
 
 
324 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1843  thiamine monophosphate kinase  44.1 
 
 
324 aa  229  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.523623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>