More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3033 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  76.32 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  76.5 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
558 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  76.14 
 
 
558 aa  813    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  76.32 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
558 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  90.23 
 
 
562 aa  1005    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  80.5 
 
 
563 aa  918    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
558 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3033  putative cation:proton antiport protein  100 
 
 
561 aa  1109    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  85.41 
 
 
561 aa  955    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  76.32 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  77.36 
 
 
562 aa  868    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  86.12 
 
 
561 aa  960    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6319  putative potassium efflux transporter  64.09 
 
 
568 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.168195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
558 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  63.07 
 
 
575 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  76.5 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  77.36 
 
 
563 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  77.54 
 
 
563 aa  874    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4368  potassium efflux system protein  61.28 
 
 
583 aa  638    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.22742  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  76.32 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  63.55 
 
 
556 aa  669    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  76.5 
 
 
558 aa  816    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  76.21 
 
 
558 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  76.32 
 
 
558 aa  835    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  64.45 
 
 
567 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  75.23 
 
 
558 aa  804    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  60.73 
 
 
555 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  57.43 
 
 
566 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  56.71 
 
 
576 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1573  potassium efflux system protein  62.45 
 
 
574 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.566024  hitchhiker  0.00174372 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0292  sodium/hydrogen exchanger  56.94 
 
 
606 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0323  sodium/hydrogen exchanger  56.42 
 
 
606 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.569683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3563  putative potassium efflux transporter (ybaL)  57.07 
 
 
585 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1345  cation:proton antiporter  57.3 
 
 
572 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.267602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1281  sodium/hydrogen exchanger  57.3 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.330977  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4672  potassium efflux system protein  58.24 
 
 
549 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0455  potassium efflux system protein  58.2 
 
 
541 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.269969  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01936  cation:proton antiporter  58.63 
 
 
569 aa  568  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1325  potassium efflux system family protein  56.02 
 
 
619 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.113614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1285  potassium efflux system family protein  56.02 
 
 
619 aa  560  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433895  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  52.25 
 
 
613 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1859  potassium efflux system protein  56.46 
 
 
615 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2112  potassium efflux system protein  55.87 
 
 
624 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521521  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  54.53 
 
 
678 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  55.02 
 
 
605 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  54.04 
 
 
605 aa  523  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  54.05 
 
 
569 aa  524  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0814  sodium/hydrogen exchanger  54.05 
 
 
577 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0542248  normal  0.0778993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  54.04 
 
 
605 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  53.8 
 
 
567 aa  525  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4976  potassium efflux system protein  56.4 
 
 
607 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  52.81 
 
 
595 aa  513  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2033  sodium/hydrogen exchanger  53.25 
 
 
565 aa  514  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  51 
 
 
565 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  50.72 
 
 
562 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  52.26 
 
 
583 aa  504  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  49.55 
 
 
564 aa  495  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4947  potassium efflux system protein  55.23 
 
 
607 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  49.64 
 
 
564 aa  489  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  65.09 
 
 
408 aa  491  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  52.81 
 
 
564 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  67.43 
 
 
405 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0633  sodium/hydrogen exchanger  53.43 
 
 
572 aa  485  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4742  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  52.53 
 
 
579 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1791  TrkA-N family protein  51.35 
 
 
572 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4140  sodium/hydrogen exchanger  51.35 
 
 
571 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435228  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3291  sodium/hydrogen exchanger  51.35 
 
 
571 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.99669  normal  0.66857 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4226  sodium/hydrogen exchanger  51.35 
 
 
571 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.646549  normal  0.336088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3648  sodium/hydrogen exchanger  51.17 
 
 
571 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279447  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4142  sodium/hydrogen exchanger  67.18 
 
 
405 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807914  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3169  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  50.45 
 
 
567 aa  475  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4030  sodium/hydrogen exchanger  67.18 
 
 
405 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4122  sodium/hydrogen exchanger  50.54 
 
 
571 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.75928  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4379  sodium/hydrogen exchanger  50.45 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1796  sodium/hydrogen exchanger  51.37 
 
 
585 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1635  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  50.18 
 
 
583 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1736  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1194  potassium efflux system protein, putative  49.65 
 
 
581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0077476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1723  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  50.45 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.254074  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1216  putative potassium efflux system protein  49.64 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1059  putative potassium efflux system protein  49.64 
 
 
577 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414119  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0369  putative potassium efflux system protein  49.47 
 
 
577 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0048  putative potassium efflux system protein  49.64 
 
 
689 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0220  potassium-efflux system protein  50 
 
 
695 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.559394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  46.75 
 
 
588 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3842  cyclic nucleotide-binding protein  60.87 
 
 
582 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306863  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  45.96 
 
 
584 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  44.83 
 
 
667 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  42.93 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  42.39 
 
 
581 aa  402  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3549  cyclic nucleotide-binding protein  55.71 
 
 
582 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.864417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  44.92 
 
 
684 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0543  sodium/hydrogen exchanger  47.67 
 
 
631 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.015433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  43.22 
 
 
674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2272  sodium/hydrogen exchanger  40.73 
 
 
578 aa  349  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.668389  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2030  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.73 
 
 
509 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.203566  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  37.31 
 
 
650 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  32.6 
 
 
573 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  36.23 
 
 
652 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>