More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3001 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  63.84 
 
 		 714 aa  924    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  48.91 
 
 		 796 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  48.91 
 
 		 796 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  50.07 
 
 		 709 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 721 aa  1485    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  79.56 
 
 		 719 aa  1155    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  48.81 
 
 		 809 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  51.52 
 
 		 795 aa  702    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  50.72 
 
 		 810 aa  674    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  48.77 
 
 		 796 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  64.13 
 
 		 677 aa  926    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  48.33 
 
 		 796 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  52.25 
 
 		 795 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  73.71 
 
 		 708 aa  1076    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  69.76 
 
 		 707 aa  1048    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  63.57 
 
 		 714 aa  926    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  49.33 
 
 		 724 aa  635  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  46.16 
 
 		 881 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  46.16 
 
 		 881 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  46.31 
 
 		 882 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  46.6 
 
 		 713 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  46.16 
 
 		 921 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  46.54 
 
 		 827 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  46.16 
 
 		 921 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  46.16 
 
 		 881 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  46.36 
 
 		 679 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  46.48 
 
 		 863 aa  618  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  47.23 
 
 		 858 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  45.3 
 
 		 742 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  46.32 
 
 		 713 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  46.23 
 
 		 713 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  47.28 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  47.28 
 
 		 855 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  46.76 
 
 		 766 aa  601  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  47.12 
 
 		 781 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  47.05 
 
 		 778 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  45.47 
 
 		 726 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  43.89 
 
 		 821 aa  571  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.32 
 
 		 706 aa  552  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  42.52 
 
 		 705 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  42.34 
 
 		 725 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  42.49 
 
 		 725 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  41.16 
 
 		 731 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  41.1 
 
 		 722 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 722 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 722 aa  502  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  43.75 
 
 		 582 aa  445  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  38.54 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.57 
 
 		 706 aa  398  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  33.52 
 
 		 708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  33.01 
 
 		 703 aa  319  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  33.84 
 
 		 815 aa  310  8e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 712 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 710 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 701 aa  301  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.36 
 
 		 696 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 692 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 696 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  34.31 
 
 		 689 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1443  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 743 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  32.19 
 
 		 860 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 708 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  32.57 
 
 		 837 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 709 aa  280  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 703 aa  280  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  32.01 
 
 		 709 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.42 
 
 		 708 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.67 
 
 		 711 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.93 
 
 		 703 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  32.37 
 
 		 702 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  33.38 
 
 		 710 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 711 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  31.83 
 
 		 757 aa  271  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  33.33 
 
 		 817 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 722 aa  267  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.54 
 
 		 722 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  31.49 
 
 		 701 aa  265  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  31.64 
 
 		 701 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  30.92 
 
 		 724 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 701 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 850 aa  261  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.76 
 
 		 734 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 715 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 		 710 aa  258  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.94 
 
 		 701 aa  259  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  28.78 
 
 		 723 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 		 723 aa  258  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 859 aa  256  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  30.05 
 
 		 710 aa  257  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.49 
 
 		 703 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  31.59 
 
 		 689 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.26 
 
 		 825 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 701 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 732 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.58 
 
 		 825 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 710 aa  255  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 770 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  30.68 
 
 		 701 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>