35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2805 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 
143 aa  296  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  93.01 
 
 
143 aa  280  6.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  90.21 
 
 
143 aa  272  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3903  hypothetical protein  45.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0315  hypothetical protein  45.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0388  type VI secretion system lysozyme-related protein  45.71 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3731  hypothetical protein  40.15 
 
 
145 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.36 
 
 
141 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0244  hypothetical protein  38.35 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0236  hypothetical protein  38.35 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0238  hypothetical protein  38.35 
 
 
137 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0047  hypothetical protein  40.29 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0029  hypothetical protein  39.09 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.475972  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1198  GPW/gp25 family protein  34.86 
 
 
145 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.308622  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1228  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1109  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.09 
 
 
138 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3226  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.53 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2622  hypothetical protein  30.53 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2125  GPW/gp25 family protein  30.53 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.718172  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4076  hypothetical protein  28.24 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000287373  unclonable  0.000000759929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0092  GPW/gp25 family protein  29.84 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2545  hypothetical protein  26.77 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0298259  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000439  hypothetical protein  31.78 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319963  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05861  hypothetical protein  31.78 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3312  hypothetical protein  38.53 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3613  hypothetical protein  29.84 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.231309  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1122  putative type VI secretion protein VasS  24.37 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43020  hypothetical protein  26.15 
 
 
135 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.434691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5431  hypothetical protein  31.45 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5593  hypothetical protein  27.64 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  28.45 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0430  tail lysozyme, putative  32.71 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2817  hypothetical protein  35.37 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3643  type VI secretion system lysozyme-related protein  24.19 
 
 
140 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.792482  normal  0.717255 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  29.68 
 
 
159 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>