63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2801 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  83.24 
 
 
173 aa  309  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  81.61 
 
 
174 aa  308  4e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  48.28 
 
 
174 aa  174  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  47.7 
 
 
174 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.13 
 
 
174 aa  171  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  49.71 
 
 
181 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  49.71 
 
 
181 aa  167  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  45.78 
 
 
177 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  43.27 
 
 
176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  45.18 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  44.38 
 
 
177 aa  157  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  42.86 
 
 
190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  39.87 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  35.12 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  34.26 
 
 
265 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  30.23 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  31.01 
 
 
154 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  29.36 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  30.56 
 
 
265 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  25.81 
 
 
151 aa  62.4  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  28.87 
 
 
168 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  31.73 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  33.01 
 
 
167 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  24.11 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  26.22 
 
 
160 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  27.1 
 
 
166 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  29.35 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.73 
 
 
170 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  29.35 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  27.21 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  29.35 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  27.21 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  27.21 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  27.21 
 
 
163 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  21.53 
 
 
156 aa  47.8  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  23.81 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  23.78 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25 
 
 
164 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  24.82 
 
 
166 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  26.73 
 
 
155 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  24 
 
 
197 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.41 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.85 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  25.93 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  25.93 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  25.93 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  25.93 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  31.11 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  24.83 
 
 
154 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  24.47 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  24.03 
 
 
168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  21.79 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  25.53 
 
 
171 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  23.26 
 
 
168 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  23.23 
 
 
292 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  22.9 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>