More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2798 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  46.16 
 
 
865 aa  667    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  51.14 
 
 
875 aa  754    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.23 
 
 
910 aa  652    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  45.53 
 
 
878 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  42.16 
 
 
916 aa  639    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1205  ATPase  57.14 
 
 
873 aa  993    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.394277  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  44.74 
 
 
882 aa  636    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0097  ATPase  48.97 
 
 
866 aa  710    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  45.46 
 
 
905 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2548  clpB protein, putative  47.24 
 
 
867 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575234  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  48.13 
 
 
882 aa  728    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  46.54 
 
 
897 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  46.85 
 
 
889 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  45.18 
 
 
867 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  44.94 
 
 
881 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  45.39 
 
 
899 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  44.66 
 
 
882 aa  673    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  46.34 
 
 
913 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  46.36 
 
 
902 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0395  type VI secretion ATPase  68.65 
 
 
867 aa  1141    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  45.06 
 
 
880 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  46.96 
 
 
889 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3246  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  87.16 
 
 
865 aa  1495    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  49.26 
 
 
894 aa  794    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  48.65 
 
 
885 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  46.32 
 
 
899 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  46.61 
 
 
889 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1079  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  86.81 
 
 
865 aa  1473    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0505801  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0021  clpB protein  60.87 
 
 
869 aa  1022    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1221  chaperone protein clpB  64.92 
 
 
911 aa  1097    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.362993 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  49.26 
 
 
878 aa  703    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  45.21 
 
 
882 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  42.46 
 
 
900 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  46.96 
 
 
889 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  47.99 
 
 
887 aa  712    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0229  type VI secretion ATPase  62.91 
 
 
923 aa  1075    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1102  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  65.14 
 
 
911 aa  1101    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  45.87 
 
 
865 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2798  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  100 
 
 
872 aa  1753    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.425597  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2520  type VI secretion ATPase  60.89 
 
 
863 aa  1018    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  45.78 
 
 
889 aa  689    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3610  type VI secretion ATPase  47.95 
 
 
875 aa  722    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1119  chaperone ClpB  46 
 
 
872 aa  671    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  45.36 
 
 
893 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  46.96 
 
 
889 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  46.71 
 
 
889 aa  696    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  42.24 
 
 
902 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0231  ATP-dependent chaperone protein ClpB  62.97 
 
 
919 aa  1075    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  46.96 
 
 
889 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  47.06 
 
 
889 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0322  type VI secretion ATPase  68.76 
 
 
867 aa  1144    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  43.28 
 
 
868 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  46.83 
 
 
889 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  42.13 
 
 
902 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0237  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  62.69 
 
 
923 aa  1073    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42980  putative ClpA/B-type protease  48.46 
 
 
877 aa  729    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172523  normal  0.0852173 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  46.96 
 
 
889 aa  709    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  46.83 
 
 
889 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  43.42 
 
 
884 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  44.48 
 
 
880 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  60.61 
 
 
895 aa  1033    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.27 
 
 
891 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000450  ClpB protein  53.17 
 
 
687 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0220453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  46.54 
 
 
897 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  45.41 
 
 
865 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  43.05 
 
 
898 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  44.66 
 
 
880 aa  635  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  40.13 
 
 
872 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.35 
 
 
869 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  39.34 
 
 
909 aa  635  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.73 
 
 
898 aa  632  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  43.12 
 
 
904 aa  631  1e-179  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  41.79 
 
 
903 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  43.58 
 
 
888 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  43.49 
 
 
887 aa  623  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.69 
 
 
888 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  44.27 
 
 
889 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.81 
 
 
888 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  43.39 
 
 
885 aa  622  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  43.19 
 
 
909 aa  619  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  42.08 
 
 
887 aa  618  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 
884 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 
884 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  41.88 
 
 
855 aa  618  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 
884 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  43.47 
 
 
884 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  43.94 
 
 
891 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  44.82 
 
 
889 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  40.94 
 
 
897 aa  614  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  43.33 
 
 
885 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  43.33 
 
 
885 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  42.61 
 
 
906 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  45.92 
 
 
846 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  42.82 
 
 
887 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  42.74 
 
 
897 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.58 
 
 
884 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1482  ATPase  41.54 
 
 
925 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  45.94 
 
 
842 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  41.88 
 
 
928 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  42.44 
 
 
918 aa  598  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>