161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2794 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1208 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1099  type VI secretion protein IcmF  44.34 
 
 		 1153 aa  935    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  45.41 
 
 		 1177 aa  1048    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0228  hypothetical protein  43.35 
 
 		 1174 aa  943    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.164141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  88.15 
 
 		 1165 aa  2112    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0226  hypothetical protein  43.35 
 
 		 1174 aa  942    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1218  hypothetical protein  44.25 
 
 		 1153 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.19667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 1194 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  87.04 
 
 		 1165 aa  2074    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1165 aa  2378    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  40.38 
 
 		 1008 aa  759    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  36.23 
 
 		 1187 aa  808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  36.36 
 
 		 1182 aa  798    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  45.41 
 
 		 1177 aa  1048    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  34.96 
 
 		 1194 aa  629  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  34.61 
 
 		 1206 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2130  ImcF domain-containing protein  34.78 
 
 		 1206 aa  619  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  33.79 
 
 		 1205 aa  593  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  25.54 
 
 		 1172 aa  373  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1176 aa  353  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  27.13 
 
 		 1102 aa  331  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  25.85 
 
 		 1209 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  25.87 
 
 		 1171 aa  315  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  25.85 
 
 		 1209 aa  314  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  25.17 
 
 		 1182 aa  313  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1208 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  23.28 
 
 		 1181 aa  308  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 1209 aa  303  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  25.5 
 
 		 1199 aa  299  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  25.29 
 
 		 1218 aa  298  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  25.7 
 
 		 1212 aa  298  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  25.85 
 
 		 1179 aa  297  6e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  25.17 
 
 		 1179 aa  295  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  24.61 
 
 		 1209 aa  289  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  24.98 
 
 		 1211 aa  281  5e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1205 aa  275  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1192 aa  271  4e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1175 aa  271  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  24.29 
 
 		 1207 aa  270  8e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1168 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  26.29 
 
 		 1220 aa  265  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  24.86 
 
 		 1175 aa  263  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  25 
 
 		 1175 aa  261  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  24.11 
 
 		 1302 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  24.65 
 
 		 1157 aa  254  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000435  IcmF-related protein  22.48 
 
 		 1130 aa  251  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.127342  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  24.24 
 
 		 1268 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05857  hypothetical protein  22.08 
 
 		 1129 aa  244  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  24.03 
 
 		 1164 aa  242  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  25.34 
 
 		 1204 aa  241  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  23.77 
 
 		 1302 aa  238  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  23.83 
 
 		 1302 aa  237  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  23.77 
 
 		 1302 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  24.76 
 
 		 1302 aa  235  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  25.38 
 
 		 1152 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  23.65 
 
 		 1181 aa  231  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  24.29 
 
 		 1302 aa  231  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1195 aa  218  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  22.92 
 
 		 1329 aa  209  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  25.14 
 
 		 1365 aa  194  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  23.28 
 
 		 1348 aa  191  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  24.2 
 
 		 1369 aa  190  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  26.06 
 
 		 1366 aa  188  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  23.77 
 
 		 1148 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  23.98 
 
 		 1365 aa  184  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  23.23 
 
 		 1275 aa  181  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  23.23 
 
 		 1275 aa  181  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  24.01 
 
 		 1317 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1332 aa  172  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1270 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  25.71 
 
 		 830 aa  157  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  22.09 
 
 		 1230 aa  153  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  26.18 
 
 		 830 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  22.57 
 
 		 1150 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  22.63 
 
 		 1358 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  22.63 
 
 		 1358 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  26.16 
 
 		 831 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  22.37 
 
 		 1358 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  25.67 
 
 		 831 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  27.61 
 
 		 831 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  27.61 
 
 		 831 aa  141  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  21.82 
 
 		 1288 aa  141  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1026  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1167 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170738  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2000  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1167 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0805  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1167 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00300591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0717  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1167 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.319931  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0500  hypothetical protein  21.26 
 
 		 973 aa  138  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1885  ImcF-like family protein  21.56 
 
 		 1164 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0217268  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0524  hypothetical protein  21.46 
 
 		 973 aa  134  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0454  hypothetical protein  21.71 
 
 		 1147 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  26.11 
 
 		 1335 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.14 
 
 		 1176 aa  130  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1173 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  25.67 
 
 		 1310 aa  121  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.52 
 
 		 1173 aa  121  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>