288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2733 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  64.1 
 
 
1066 aa  1387    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  65.49 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  65.49 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  48.99 
 
 
1041 aa  1001    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  65.29 
 
 
1024 aa  1341    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1768  beta-D-galactosidase  69.17 
 
 
1043 aa  1470    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.035592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  64.9 
 
 
1024 aa  1353    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  77.52 
 
 
1032 aa  1651    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2733  beta-D-galactosidase  100 
 
 
1036 aa  2137    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000508239  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  71.16 
 
 
1029 aa  1520    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  36.19 
 
 
1019 aa  640    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  51.94 
 
 
1031 aa  1090    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1316  beta-D-galactosidase  49.18 
 
 
1036 aa  1028    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1362  beta-D-galactosidase  70.7 
 
 
1043 aa  1491    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00215799  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2019  beta-D-galactosidase  51.69 
 
 
1035 aa  1064    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0466092  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119488  Beta-galactosidase, putative  38.04 
 
 
1164 aa  677    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.873023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  63.74 
 
 
1028 aa  1347    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  64.47 
 
 
1050 aa  1389    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  65.49 
 
 
1024 aa  1343    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  53.06 
 
 
1044 aa  1056    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  64.9 
 
 
1024 aa  1327    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  64.01 
 
 
1066 aa  1387    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  65.59 
 
 
1024 aa  1349    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  65.59 
 
 
1024 aa  1348    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0821  glycoside hydrolase family protein  36.31 
 
 
1079 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00114768  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  35.69 
 
 
1084 aa  621  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2370  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.97 
 
 
1026 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0768675  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.86 
 
 
1033 aa  618  1e-175  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  35.39 
 
 
1084 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2714  Beta-galactosidase  38.24 
 
 
1020 aa  608  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204643  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  35.99 
 
 
1063 aa  602  1e-170  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4484  glycoside hydrolase family protein  35.49 
 
 
1049 aa  593  1e-168  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.137937  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2493  Beta-galactosidase  36.29 
 
 
1043 aa  588  1e-166  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  35.57 
 
 
1129 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  34.24 
 
 
1076 aa  570  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3118  glycoside hydrolase family protein  32.83 
 
 
1043 aa  572  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  36.91 
 
 
1094 aa  565  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  32.79 
 
 
1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  34.38 
 
 
1059 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4102  Beta-galactosidase  31.89 
 
 
1108 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.283499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.05 
 
 
1030 aa  553  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  33.02 
 
 
1045 aa  551  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.82 
 
 
1041 aa  551  1e-155  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1013  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.8 
 
 
1033 aa  552  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  32 
 
 
1455 aa  543  1e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002658  beta-D-galactosidase alpha subunit  32.88 
 
 
1032 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454065  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3370  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.05 
 
 
1030 aa  545  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02895  hypothetical protein  33.66 
 
 
1030 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02945  cryptic beta-D-galactosidase, alpha subunit  33.66 
 
 
1030 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  34.67 
 
 
1045 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  32.32 
 
 
1046 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0625  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.66 
 
 
1030 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1973  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  34.04 
 
 
1030 aa  539  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.75541  hitchhiker  0.00919107 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0624  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.76 
 
 
1030 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  35.62 
 
 
1003 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3543  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.66 
 
 
1030 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4390  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.56 
 
 
1030 aa  535  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3258  cryptic beta-D-galactosidase subunit alpha  33.4 
 
 
1030 aa  534  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  33.99 
 
 
1077 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  35.18 
 
 
1023 aa  520  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0750  beta-galactosidase  30.43 
 
 
1009 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0186034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0766  beta-galactosidase  30.24 
 
 
1012 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.156765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  32.83 
 
 
1035 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03201  beta-galactosidase (Eurofung)  32.71 
 
 
1030 aa  503  1e-141  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112028 
 
 
-
 
NC_002950  PG0665  beta-galactosidase  33.43 
 
 
1112 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4961  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.72 
 
 
1018 aa  506  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.47 
 
 
1013 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  31.84 
 
 
1026 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.55 
 
 
1289 aa  492  1e-137  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3466  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.27 
 
 
968 aa  486  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.52907  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2469  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.82 
 
 
1036 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3379  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.18 
 
 
992 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1433  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.75 
 
 
1003 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2720  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.28 
 
 
1053 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.32 
 
 
1264 aa  471  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3719  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  33.37 
 
 
1004 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5411  beta-galactosidase  31.64 
 
 
1008 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111624  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3917  glycoside hydrolase family protein  33.4 
 
 
1020 aa  458  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  33.59 
 
 
1012 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14320  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  33.76 
 
 
992 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3187  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 
1022 aa  446  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0920  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.59 
 
 
1005 aa  432  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0700596  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  30.91 
 
 
1017 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26640  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.32 
 
 
996 aa  426  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3257  glycoside hydrolase family protein  31.91 
 
 
1017 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  30.73 
 
 
1023 aa  418  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30036  Beta-galactosidase (Lactase)  30.18 
 
 
1021 aa  400  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0855272  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  29.42 
 
 
1329 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.14 
 
 
1424 aa  344  4e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2025  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 
640 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00409776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0288  glycoside hydrolase family protein  33.13 
 
 
628 aa  311  4e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000148878  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3832  predicted protein  41.46 
 
 
349 aa  280  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3909  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  32.17 
 
 
1600 aa  261  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2782  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.74 
 
 
920 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396863  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
987 aa  166  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2734  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.8 
 
 
920 aa  164  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
766 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  27.19 
 
 
972 aa  144  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 
803 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  29.14 
 
 
811 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>