More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2676 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2676  Diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  859    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.438266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2585  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  70.99 
 
 		 402 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.126508  decreased coverage  0.000677908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4782  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.23 
 
 		 408 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.49913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001062  vibrioferrin decarboxylase protein PvsE  44.84 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.01 
 
 		 392 aa  329  7e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0717  diaminopimelate decarboxylase  47.77 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0591874 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3096  diaminopimelate decarboxylase  46.48 
 
 		 394 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.294938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09300  diaminopimelate decarboxylase  48.49 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000620759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1275  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.61 
 
 		 421 aa  309  6.999999999999999e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.548043  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00881  diaminopimelate decarboxylase protein  42.57 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0145136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01927  diaminopimelate decarboxylase  45.72 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0114  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.49 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.49 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1110  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.78 
 
 		 397 aa  286  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.585964  normal  0.770001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.62 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3735  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.45 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0413562  normal  0.130406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4867  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.73 
 
 		 373 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6954  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.05 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2972  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.43 
 
 		 362 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.980745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8366  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.3 
 
 		 392 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.42 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.76 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  34.38 
 
 		 416 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4053  diaminopimelate decarboxylase  32.54 
 
 		 484 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.9 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.99 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  34.38 
 
 		 415 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.03 
 
 		 411 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.52 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.17 
 
 		 402 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.84 
 
 		 413 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.39 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  31.61 
 
 		 402 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  34.02 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.39 
 
 		 430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.43 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.07 
 
 		 412 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.25 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  32.97 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0663  diaminopimelate decarboxylase  35.45 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  32.7 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.8 
 
 		 414 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.78 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.16 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  32.3 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  31.33 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.22 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  32.74 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  32.48 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.92 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.43 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  32.48 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.26 
 
 		 419 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  30.95 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  30.08 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  30.26 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  31.75 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  29.97 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  30.03 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.03 
 
 		 508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  32.73 
 
 		 418 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  32.17 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  31.71 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  32.49 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  27.09 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  28.87 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  32.4 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  28.9 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  31.13 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  31.59 
 
 		 417 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 416 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  31.06 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.52 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  31.53 
 
 		 415 aa  133  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  28.92 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  31.99 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  30.47 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.46 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  30.39 
 
 		 416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 414 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.02 
 
 		 440 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  32.74 
 
 		 415 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  31.01 
 
 		 414 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  29.07 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  29.18 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3135  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.69 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0167539  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0681  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.47 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  30.87 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>