279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2670 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2670  periplasmic binding protein  100 
 
 
272 aa  548  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2590  periplasmic binding protein  68.63 
 
 
301 aa  384  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37556  normal  0.0169021 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2940  periplasmic binding protein  64.5 
 
 
316 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1523  periplasmic binding protein  65 
 
 
313 aa  343  1e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1043  periplasmic binding protein  50.57 
 
 
340 aa  281  6e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0463  periplasmic binding protein  49.43 
 
 
308 aa  268  6e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0106  periplasmic binding protein  36.57 
 
 
330 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  1.00605e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0102  periplasmic binding protein  36.57 
 
 
330 aa  199  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.4163e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2264  periplasmic binding protein  31.06 
 
 
324 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1987  periplasmic binding protein  30.34 
 
 
324 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.25239e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2422  periplasmic binding protein  36.5 
 
 
300 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2122  periplasmic binding protein  33.33 
 
 
298 aa  140  2e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10692  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2237  putative iron compound-binding protein  29.96 
 
 
305 aa  137  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0793747  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0778  lipoprotein  30.45 
 
 
316 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.662712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0652  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.36 
 
 
322 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000476646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2078  periplasmic binding protein  29.59 
 
 
320 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0923581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0529  periplasmic binding protein  28.73 
 
 
322 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00029355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3087  putative iron compound-binding protein  29.59 
 
 
320 aa  136  3e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.32473  hitchhiker  9.18537e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  28.36 
 
 
321 aa  135  6e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.36 
 
 
321 aa  135  6e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.33829e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2038  iron(III) dicitrate-binding protein  29.21 
 
 
320 aa  135  7e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.24878e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  28.36 
 
 
321 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  2.68482e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2099  substrate-binding family protein  29.21 
 
 
320 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.70129e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2255  substrate-binding family protein  29.21 
 
 
320 aa  135  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00818777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2280  putative iron compound-binding protein  29.21 
 
 
320 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17371e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.36 
 
 
321 aa  135  1e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  2.82355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2365  putative iron compound-binding protein  28.84 
 
 
320 aa  134  1e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00267184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  28.36 
 
 
321 aa  135  1e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  6.73134e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0743  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.99 
 
 
321 aa  134  1e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.97265e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.99 
 
 
322 aa  134  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7046e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0683  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  27.61 
 
 
321 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2036  iron(III) dicitrate-binding protein  28.84 
 
 
320 aa  131  1e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  1.0516e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2283  substrate-binding family protein, putative  28.84 
 
 
321 aa  131  1e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00918063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0413  periplasmic binding protein  30.42 
 
 
319 aa  129  4e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0133  periplasmic binding protein  28.25 
 
 
306 aa  125  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  30.68 
 
 
662 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2440  periplasmic binding protein  32.26 
 
 
348 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2115e-07 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1784  hypothetical protein  30.19 
 
 
309 aa  118  1e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.933909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7985  substrate-binding family protein, putative  30.34 
 
 
336 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428373  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5759  periplasmic binding protein  29.39 
 
 
331 aa  115  7e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0550  periplasmic binding protein  29 
 
 
313 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3525  periplasmic binding protein  28.3 
 
 
310 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0693  periplasmic binding protein  27.21 
 
 
306 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1777  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.91 
 
 
331 aa  99  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2699  periplasmic binding protein  29.86 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.885635  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0742  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.78 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04156  iron-dicitrate transporter subunit  28.78 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04119  hypothetical protein  28.78 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3710  periplasmic binding protein  28.78 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.508283  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4867  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.78 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0667  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  29.06 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4123  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
346 aa  92.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0763  iron(III) dicitrate transport system, periplasmic iron-binding protein FecB  29.32 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0974  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  27.51 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4780  periplasmic binding protein  28.99 
 
 
305 aa  89.4  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30510  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.05 
 
 
326 aa  88.6  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163783  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2409  periplasmic binding protein  30.29 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0140485  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1097  periplasmic binding protein  23.86 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.53945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1119  periplasmic binding protein  23.86 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  5.65066e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2064  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
313 aa  84.7  1e-15  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  24.73 
 
 
319 aa  84.3  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2208  periplasmic binding protein  21.98 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.970371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2246  periplasmic binding protein  21.98 
 
 
327 aa  84.7  2e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.13483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3654  periplasmic binding protein  28.04 
 
 
329 aa  83.6  3e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.841476  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1832  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
353 aa  83.2  4e-15  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.136123  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1851  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
353 aa  83.6  4e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1898  periplasmic binding protein  27.88 
 
 
353 aa  83.6  4e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2416  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
311 aa  82.4  7e-15  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3865  periplasmic binding protein  26.13 
 
 
329 aa  82.4  7e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001069  iron(III) dicitrate transport system iron-binding protein fecB  27.94 
 
 
307 aa  80.9  2e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2421  periplasmic binding protein  27.92 
 
 
309 aa  80.5  3e-14  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2491  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
316 aa  79.7  4e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2829  twin-arginine translocation pathway signal  25.55 
 
 
300 aa  79.3  6e-14  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.582079  normal  0.501847 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06007  iron-dicitrate transporter substrate-binding subunit  28.41 
 
 
298 aa  78.2  1e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13060  Fe(III)-dicitrate-binding periplasmic lipoprotein fecB  26.47 
 
 
359 aa  78.6  1e-13  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0425065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1282  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
357 aa  77.4  2e-13  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2757  periplasmic binding protein  25.76 
 
 
309 aa  77  3e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2413  periplasmic binding protein  30.07 
 
 
351 aa  76.3  5e-13  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4510  periplasmic binding protein  23.08 
 
 
317 aa  74.7  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0599  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  73.6  3e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  72.8  5e-12  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  72.8  5e-12  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  5.18711e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0640  periplasmic binding protein  25.37 
 
 
337 aa  73.2  5e-12  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.451068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  72.8  5e-12  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  72.8  5e-12  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7292  ABC transporter membrane spanning protein (iron(III) dicitrate)  26.98 
 
 
311 aa  72.8  6e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2754  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
312 aa  72  9e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.13 
 
 
324 aa  72  9e-12  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2294  periplasmic binding protein  25.47 
 
 
330 aa  71.6  1e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4143  iron chelate ABC transporter periplasmic iron-binding protein  24.28 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0242829  normal  0.0341564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4091  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  24.28 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0071  periplasmic binding protein  24.28 
 
 
317 aa  71.2  2e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2189  periplasmic binding protein  28.79 
 
 
309 aa  69.3  6e-11  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2582  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  27.44 
 
 
319 aa  68.9  9e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00742029  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3245  iron compound ABC transporter, substrate-binding protein  21.88 
 
 
299 aa  68.6  9e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.44185e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4269  periplasmic binding protein  22.68 
 
 
314 aa  68.9  9e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0364817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3275  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.88 
 
 
259 aa  68.6  1e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3531  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  21.88 
 
 
259 aa  68.6  1e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3489  putative iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  21.88 
 
 
299 aa  68.2  1e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2081  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
380 aa  67.4  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.754693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>