89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2657 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  100 
 
 		 426 aa  857    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  91.78 
 
 		 426 aa  735    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  77.04 
 
 		 421 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  73.02 
 
 		 420 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  73.24 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  72.99 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  72.77 
 
 		 420 aa  589  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  61.38 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  61.64 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  61.64 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  62.41 
 
 		 418 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  61.65 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  60.1 
 
 		 417 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  57.14 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  50.12 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.25 
 
 		 410 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  45.88 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  40.59 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  37.01 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  36.88 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  34.44 
 
 		 415 aa  245  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  30.25 
 
 		 445 aa  202  9e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  23.62 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  25.99 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.27 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.27 
 
 		 388 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  24.66 
 
 		 410 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.76 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.47 
 
 		 387 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2709  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2795  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2754  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 384 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2816  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2929  putative 3-phenylpropionic acid transporter  22.49 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  26.15 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3905  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0290855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3831  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3817  general substrate transporter  34.68 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133781 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 407 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  35.62 
 
 		 893 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.8 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1391  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0432  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 474 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3043  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.35 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0906108  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1315  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.457809  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1801  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 474 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0665  hypothetical protein  28.09 
 
 		 183 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.8 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.8 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  33.78 
 
 		 917 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3822  general substrate transporter  30.49 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325585  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1886  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 474 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0213  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0948  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3767  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.39 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1544  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 189 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3910  general substrate transporter  29.2 
 
 		 441 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.92 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.38 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  21.61 
 
 		 390 aa  43.5  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3836  general substrate transporter  29.2 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  24.27 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02392  hypothetical protein  24.12 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2688  putative 3-phenylpropionic acid transporter  24.12 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117825  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  26.55 
 
 		 491 aa  43.1  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0350  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 474 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02428  predicted 3-phenylpropionic transporter  24.12 
 
 		 379 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>