35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2646 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  100 
 
 
268 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  69.81 
 
 
272 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  63.3 
 
 
271 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  63.3 
 
 
271 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  49.62 
 
 
255 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  48.85 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  32.34 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  32.65 
 
 
303 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  32 
 
 
308 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  32.77 
 
 
323 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  31.74 
 
 
307 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  30.24 
 
 
307 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  28.68 
 
 
395 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  29.1 
 
 
477 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  28.08 
 
 
934 aa  82  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  28.38 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  29.41 
 
 
640 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  27.86 
 
 
688 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03990  peptidase C1A, papain  24.14 
 
 
592 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.74 
 
 
688 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3607  peptidase C1A papain  26.58 
 
 
270 aa  61.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  26.43 
 
 
820 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  26.81 
 
 
789 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3428  hypothetical protein  26.78 
 
 
652 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5291  peptidase C1A papain  45.65 
 
 
354 aa  52.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.185879  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3073  hypothetical protein  25.94 
 
 
652 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0178105  normal  0.449437 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  24.7 
 
 
270 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  24.29 
 
 
405 aa  49.3  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0213  peptidase C1A papain  39.58 
 
 
814 aa  48.5  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1673  peptidase C1A, papain  25.96 
 
 
368 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00360531  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2509  hypothetical protein  25.1 
 
 
364 aa  45.8  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  26.27 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2639  hypothetical protein  43.14 
 
 
364 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  22.28 
 
 
599 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  25.69 
 
 
224 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>