More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2602 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  100 
 
 
285 aa  557  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  82.96 
 
 
287 aa  455  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  82.96 
 
 
287 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  80.14 
 
 
286 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  78.93 
 
 
294 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  78.93 
 
 
294 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  78.57 
 
 
294 aa  432  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  67.27 
 
 
285 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  68.12 
 
 
285 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  67.75 
 
 
285 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  67.03 
 
 
285 aa  378  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  67.74 
 
 
296 aa  378  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  64.16 
 
 
286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  64.16 
 
 
286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  68.38 
 
 
286 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  68.27 
 
 
286 aa  374  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  64.16 
 
 
286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  64.16 
 
 
286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  64.16 
 
 
286 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  69.06 
 
 
291 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  68.05 
 
 
294 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  67.27 
 
 
285 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  65.12 
 
 
286 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  67.03 
 
 
286 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  65.81 
 
 
299 aa  345  5e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  62.5 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  62.5 
 
 
286 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  59.5 
 
 
285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  62.88 
 
 
286 aa  326  3e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  48.23 
 
 
291 aa  258  9e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  46.01 
 
 
294 aa  249  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  47.62 
 
 
289 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  46.69 
 
 
289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  47.08 
 
 
290 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  47.45 
 
 
290 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  46.24 
 
 
274 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  43.55 
 
 
291 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  46.47 
 
 
290 aa  235  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  46.1 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  44.91 
 
 
285 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  47.21 
 
 
290 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  47.29 
 
 
275 aa  219  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  45.72 
 
 
303 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  46.47 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  45.11 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  43.93 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  44.23 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  43.75 
 
 
276 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  43.17 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  42.7 
 
 
285 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  45.15 
 
 
281 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  40.3 
 
 
280 aa  209  6e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  40.86 
 
 
282 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  45.96 
 
 
291 aa  205  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  42.03 
 
 
282 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  40.78 
 
 
288 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.67 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  38.08 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.67 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.67 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  43.56 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  41.67 
 
 
282 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  39.57 
 
 
297 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  39.57 
 
 
297 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  39.57 
 
 
297 aa  199  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  43.37 
 
 
306 aa  200  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  43.35 
 
 
279 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41.07 
 
 
285 aa  198  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  42.8 
 
 
285 aa  196  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  43.24 
 
 
295 aa  194  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  43.01 
 
 
289 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.44 
 
 
288 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  41.22 
 
 
279 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0724  AfeC  36.78 
 
 
274 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.251948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  40.14 
 
 
283 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  44.32 
 
 
294 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  43.02 
 
 
285 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  43.14 
 
 
280 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  40.78 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  40.78 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  42.21 
 
 
314 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  39.03 
 
 
289 aa  188  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  36.46 
 
 
300 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  37.83 
 
 
280 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  36.69 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  36.69 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  37.72 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  36.69 
 
 
304 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  38.08 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  37.63 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  38.55 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.97 
 
 
285 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.86 
 
 
276 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  37.27 
 
 
271 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  34.21 
 
 
277 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  38.85 
 
 
280 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.44 
 
 
278 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.44 
 
 
278 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.45 
 
 
279 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>