74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2560 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 		 174 aa  358  2e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  57.58 
 
 		 169 aa  191  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  44.38 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  57.89 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  58.44 
 
 		 323 aa  98.6  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  54.35 
 
 		 94 aa  97.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  54.35 
 
 		 94 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  50.51 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  46.67 
 
 		 592 aa  77.8  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  45.36 
 
 		 540 aa  74.3  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 466 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  43.43 
 
 		 456 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  40.57 
 
 		 456 aa  67.8  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  44.57 
 
 		 100 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  45.65 
 
 		 88 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  42 
 
 		 461 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  50 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  45.57 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  40.43 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  43.84 
 
 		 1527 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  31.16 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1541 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  30.39 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  45.33 
 
 		 1381 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  28.25 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  42.86 
 
 		 1385 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  42.86 
 
 		 1400 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  44 
 
 		 1553 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  41.38 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  41.43 
 
 		 1386 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  33.56 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 406 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  44.59 
 
 		 855 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1293  PAAR  38.89 
 
 		 96 aa  50.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1409 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  36.08 
 
 		 1421 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 1229 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  36.46 
 
 		 1422 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 113 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.37 
 
 		 1446 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  40 
 
 		 1447 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  39.19 
 
 		 1428 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  40.4 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  37.21 
 
 		 386 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0281  hypothetical protein  32.95 
 
 		 84 aa  45.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6683  PAAR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 88 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  39.73 
 
 		 1140 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1487 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  36 
 
 		 1494 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  36 
 
 		 1494 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  38.57 
 
 		 1411 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  35.62 
 
 		 1495 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  39.8 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  29.94 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  39.19 
 
 		 1423 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  42.68 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 88 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  35.9 
 
 		 1419 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0641  hypothetical protein  31.91 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2358  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 96 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  36.49 
 
 		 1457 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 93 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  36.49 
 
 		 1475 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  35.21 
 
 		 118 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3018  PAAR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 88 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.820198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  33.71 
 
 		 86 aa  41.6  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 94 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 94 aa  41.2  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 92 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>