48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2491 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 566 aa  1158    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  60.42 
 
 		 580 aa  670    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  32.28 
 
 		 885 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 1332 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  29.91 
 
 		 1029 aa  89  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4789  hypothetical protein  31.48 
 
 		 710 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.51 
 
 		 12684 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2442  cellulosome protein dockerin type I  29.28 
 
 		 870 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1900  hypothetical protein  36.43 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0528132 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4783  hypothetical protein  31.72 
 
 		 701 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.292143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 671 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.81 
 
 		 834 aa  73.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0356  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1011 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161093  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1406 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2229  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 659 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1913  hypothetical protein  24.31 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5875  hypothetical protein  28.4 
 
 		 543 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.191888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1607  hypothetical protein  25.41 
 
 		 826 aa  58.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0443973  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.04 
 
 		 999 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  33.33 
 
 		 995 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  35.19 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2228  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 		 652 aa  57  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0829706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  33.86 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.29 
 
 		 1887 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  31.33 
 
 		 518 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  27.88 
 
 		 770 aa  56.2  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.48 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  31.03 
 
 		 670 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 340 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  32.73 
 
 		 1042 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.26 
 
 		 669 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.142173  normal  0.0665505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  23.35 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  36.09 
 
 		 1973 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  26.34 
 
 		 3507 aa  50.8  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.38 
 
 		 1363 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  27.45 
 
 		 1050 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  34.56 
 
 		 2068 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  25.53 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  35.34 
 
 		 651 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  24.71 
 
 		 518 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  32.26 
 
 		 478 aa  45.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  32.8 
 
 		 1363 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  25.15 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  50 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  32.26 
 
 		 1154 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  35.35 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  27.03 
 
 		 779 aa  43.9  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  32.14 
 
 		 1380 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>