118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2427 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  87.15 
 
 		 392 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  100 
 
 		 393 aa  781    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  79.8 
 
 		 392 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  78.97 
 
 		 392 aa  624  1e-178  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  73.01 
 
 		 409 aa  603  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  69.47 
 
 		 393 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  68.7 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  68.7 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  68.7 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  68.45 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  68.45 
 
 		 393 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  67.94 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  67.94 
 
 		 393 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  67.94 
 
 		 393 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  67.68 
 
 		 393 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  59.95 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  59.69 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  59.95 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  59.95 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  59.95 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  59.95 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  59.95 
 
 		 394 aa  495  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  59.88 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  54.08 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  54.08 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  54.08 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  53.49 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  53.49 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  53.49 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  53.49 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  53.23 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  53.49 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  53.61 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  55.56 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  52.89 
 
 		 381 aa  362  7.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  47.03 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  38.69 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  35.08 
 
 		 404 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  32.27 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 411 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  29.22 
 
 		 456 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  28.49 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 431 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 397 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 388 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0397  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1192  MFS permease  22.19 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.879235  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0009  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  41.04 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  29.82 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  22.64 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3820  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 404 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0118645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  24.46 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  25.52 
 
 		 393 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  25.84 
 
 		 398 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0070  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 438 aa  50.1  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0184  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133276  normal  0.55787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.28 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 410 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 432 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.59 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  23.64 
 
 		 433 aa  47.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  30.67 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.9 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  27.78 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3527  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.87 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0724  XRE family transcriptional regulator  20.06 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0248517  normal  0.732521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3253  benzoate transport  31.25 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>