More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2425 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  100 
 
 
312 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  95.51 
 
 
312 aa  618  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  94.87 
 
 
312 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  96.79 
 
 
312 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
313 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  91.03 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  91.03 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  91.03 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  91.99 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  90.71 
 
 
312 aa  570  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  91.03 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  91.03 
 
 
312 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  90.38 
 
 
312 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  90.38 
 
 
312 aa  567  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  90.06 
 
 
312 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  49.52 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  47.4 
 
 
323 aa  280  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  46.75 
 
 
324 aa  278  7e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  44.87 
 
 
325 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  44.52 
 
 
313 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  44.01 
 
 
313 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  44.92 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  44.59 
 
 
315 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  44.69 
 
 
315 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  44.81 
 
 
314 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 
315 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  45.87 
 
 
308 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  45.25 
 
 
315 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  43.37 
 
 
313 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  42.48 
 
 
313 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  44.01 
 
 
306 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  40.28 
 
 
316 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  40.69 
 
 
318 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  40 
 
 
318 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  42.24 
 
 
322 aa  202  5e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  44.36 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  43.05 
 
 
318 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  38.64 
 
 
317 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  41.95 
 
 
315 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  34.97 
 
 
311 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  45.28 
 
 
328 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.62 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  42.26 
 
 
328 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  42.26 
 
 
328 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  38.14 
 
 
326 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  38.81 
 
 
318 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  31.61 
 
 
308 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 
302 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  32.13 
 
 
304 aa  159  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 
322 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.14 
 
 
308 aa  155  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.21 
 
 
330 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.45 
 
 
306 aa  149  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  34.52 
 
 
321 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  29.64 
 
 
310 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  36.09 
 
 
349 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2142  1-phosphofructokinase  36.76 
 
 
313 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.954856 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  33 
 
 
312 aa  143  3e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  33.59 
 
 
303 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.56 
 
 
308 aa  143  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  33.98 
 
 
303 aa  142  7e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  29.17 
 
 
307 aa  142  7e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.57 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  33.2 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 
303 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  28.9 
 
 
311 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  33.59 
 
 
303 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.8 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  32.95 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  31.16 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  35.74 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  32.82 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.83 
 
 
314 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  33.1 
 
 
319 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.1 
 
 
319 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0891  1-phosphofructokinase  34.87 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.619432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  33.68 
 
 
310 aa  136  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  30.35 
 
 
310 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  30.99 
 
 
310 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  30.67 
 
 
310 aa  136  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 
303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.98 
 
 
303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  33.08 
 
 
306 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.78 
 
 
303 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  28.06 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  29.86 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>