138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2414 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  79.94 
 
 
361 aa  526  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  78.33 
 
 
362 aa  521  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  75.7 
 
 
363 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  75.7 
 
 
363 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  75.7 
 
 
363 aa  520  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  79.17 
 
 
362 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  67.6 
 
 
362 aa  461  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  67.6 
 
 
362 aa  461  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  67.6 
 
 
362 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  68.16 
 
 
362 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  68.72 
 
 
362 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  67.6 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  67.6 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  67.32 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  68.44 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  68.44 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  68.72 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  66.76 
 
 
362 aa  454  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  67.6 
 
 
362 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  68.16 
 
 
362 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  65.92 
 
 
362 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.06 
 
 
373 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
373 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  33.02 
 
 
359 aa  186  7e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  38.74 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.86 
 
 
385 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.67 
 
 
377 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  37.24 
 
 
396 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  32.97 
 
 
364 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  32.97 
 
 
364 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
366 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.72 
 
 
384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.16 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  35.71 
 
 
369 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  32.96 
 
 
369 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  32.53 
 
 
417 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  35.37 
 
 
369 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  35.37 
 
 
369 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
367 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  31.96 
 
 
367 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  32.24 
 
 
367 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  38.08 
 
 
363 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  36.56 
 
 
366 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  30.3 
 
 
364 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  30.47 
 
 
367 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  30.47 
 
 
367 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.93 
 
 
374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  30.47 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  30.47 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  30.19 
 
 
367 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  29.32 
 
 
363 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  30.56 
 
 
360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  32.89 
 
 
383 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.89 
 
 
380 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 
368 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  34.55 
 
 
395 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  32.33 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  33.45 
 
 
366 aa  139  6e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  31.45 
 
 
362 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  29.38 
 
 
376 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
339 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.74 
 
 
358 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.45 
 
 
365 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
367 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  29.7 
 
 
363 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 
373 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  32.34 
 
 
364 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.53 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.82 
 
 
360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.01 
 
 
364 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  29.84 
 
 
363 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  32.51 
 
 
398 aa  133  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  36.08 
 
 
366 aa  132  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.11 
 
 
364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.11 
 
 
385 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 
383 aa  129  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  29.15 
 
 
367 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  31.88 
 
 
372 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  28.25 
 
 
367 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  28.57 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  28.9 
 
 
365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  31.16 
 
 
372 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  30.43 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  32.17 
 
 
365 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  30.89 
 
 
352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0011  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.33 
 
 
381 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556568  normal  0.0107863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0985  glycerol dehydrogenase  30.39 
 
 
371 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2945  glycerol dehydrogenase  30.33 
 
 
372 aa  106  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1883  glycerol dehydrogenase  30.06 
 
 
371 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.563228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1007  glycerol dehydrogenase  30.6 
 
 
371 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>