More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2355 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
444 aa  910    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  41.05 
 
 
591 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  40.59 
 
 
425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  39.39 
 
 
595 aa  288  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  36.53 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  30.43 
 
 
635 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  31.91 
 
 
659 aa  193  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  29.5 
 
 
657 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 
669 aa  179  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  28.4 
 
 
661 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
661 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.4 
 
 
661 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  28.4 
 
 
661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  28.4 
 
 
661 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  28.4 
 
 
661 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3151  beta-lactamase domain-containing protein  31.01 
 
 
652 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13062  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.16 
 
 
661 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  29.83 
 
 
655 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3826  glucose-methanol-choline oxidoreductase:Beta-lactamase-like:FAD dependent oxidoreductase:GMC oxidoreductase  28.88 
 
 
1290 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  28.95 
 
 
670 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  28.67 
 
 
653 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  27.87 
 
 
673 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  26.33 
 
 
658 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  29.98 
 
 
657 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  28.07 
 
 
661 aa  166  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  28.95 
 
 
657 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.74 
 
 
631 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5939  beta-lactamase domain-containing protein  28.64 
 
 
675 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428975  normal  0.0291906 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  25.85 
 
 
658 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  29.12 
 
 
655 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  28.54 
 
 
654 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 
656 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  26.68 
 
 
662 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2045  metallo-beta-lactamase family protein  27.75 
 
 
653 aa  160  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  27.64 
 
 
653 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 
658 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
651 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 
651 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  26.73 
 
 
611 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  29.74 
 
 
655 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  29.09 
 
 
659 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 
696 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  28.02 
 
 
654 aa  156  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  28.05 
 
 
609 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  26.38 
 
 
660 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  27.1 
 
 
660 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  28.4 
 
 
653 aa  151  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.78 
 
 
617 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  27.62 
 
 
629 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  27.23 
 
 
654 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  28.99 
 
 
663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  28.99 
 
 
658 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  26.62 
 
 
628 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 
661 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 
417 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  25.48 
 
 
636 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  27.01 
 
 
653 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  28.71 
 
 
645 aa  144  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  25.89 
 
 
648 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  26.65 
 
 
641 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  26.79 
 
 
667 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  26.43 
 
 
625 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1063  Beta-lactamase-like  27.05 
 
 
648 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  25.48 
 
 
625 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
625 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  25.48 
 
 
625 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  26.85 
 
 
626 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
662 aa  136  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  26.57 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  26.71 
 
 
662 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  25.87 
 
 
621 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 
607 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 
661 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  26.71 
 
 
662 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.24 
 
 
663 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.56 
 
 
666 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 
673 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  25.06 
 
 
408 aa  127  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  24.65 
 
 
657 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  24.16 
 
 
680 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  24.82 
 
 
663 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3832  putative hydrolase  24.06 
 
 
668 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137026 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  24.41 
 
 
477 aa  117  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  23.19 
 
 
701 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  23.98 
 
 
700 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5689  beta-lactamase domain-containing protein  22.89 
 
 
704 aa  113  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.714189  normal  0.038494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1358  beta-lactamase domain-containing protein  22.77 
 
 
687 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.647754  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0795  beta-lactamase domain-containing protein  22.65 
 
 
704 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  22.22 
 
 
691 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  23.66 
 
 
417 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  24.83 
 
 
683 aa  106  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 
417 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  23.7 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  26.02 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  27.39 
 
 
313 aa  86.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  25.84 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  27.96 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>