More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2285 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  100 
 
 
233 aa  465  1e-130  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  63.04 
 
 
234 aa  269  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  63.48 
 
 
234 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 
234 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  58.26 
 
 
234 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  61.74 
 
 
234 aa  254  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  58.7 
 
 
234 aa  253  2e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 
234 aa  251  5e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  58.26 
 
 
234 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  58.26 
 
 
234 aa  251  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  58.93 
 
 
234 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  59.38 
 
 
234 aa  251  8e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  56.77 
 
 
232 aa  242  4e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
235 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.95 
 
 
235 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  50.64 
 
 
237 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 
234 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  49.79 
 
 
332 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  49.32 
 
 
227 aa  200  2e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  45.58 
 
 
235 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.09 
 
 
232 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  43.5 
 
 
256 aa  185  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.62 
 
 
242 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  46.88 
 
 
228 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.93 
 
 
241 aa  180  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 
228 aa  178  6e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  46.43 
 
 
228 aa  178  6e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.89 
 
 
233 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
276 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.11 
 
 
258 aa  174  1e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  50 
 
 
234 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 
237 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  43.23 
 
 
231 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  45.29 
 
 
235 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.29 
 
 
243 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  38.94 
 
 
265 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  38.77 
 
 
243 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
247 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
237 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.84 
 
 
237 aa  148  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
245 aa  148  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 
244 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.19132e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  45.5 
 
 
241 aa  145  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
237 aa  145  7e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
245 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  38.84 
 
 
238 aa  139  4e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
239 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  36.87 
 
 
243 aa  135  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
244 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
237 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  40.72 
 
 
239 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 
235 aa  120  1e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.33 
 
 
254 aa  116  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
317 aa  115  9e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  30.7 
 
 
244 aa  114  2e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
306 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  35.91 
 
 
268 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.18039e-13  hitchhiker  1.72259e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
251 aa  102  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.97 
 
 
273 aa  102  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
268 aa  102  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
270 aa  102  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.14 
 
 
254 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
251 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
285 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  40.56 
 
 
270 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
300 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
314 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.7 
 
 
338 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  38.14 
 
 
270 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
268 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
271 aa  99  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.87 
 
 
283 aa  99  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
290 aa  98.6  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.22 
 
 
304 aa  98.2  9e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
347 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  37.63 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1223  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.33 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
602 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  34.47 
 
 
286 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1049  short chain dehydrogenase  39.47 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  33.87 
 
 
283 aa  95.9  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1018  short chain dehydrogenase  37.85 
 
 
298 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.176999  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85576  1-acyl dihydroxyacetone phosphate reductase  36.36 
 
 
297 aa  95.5  6e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.764393  hitchhiker  0.00283469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  34.88 
 
 
244 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  35.16 
 
 
282 aa  95.5  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 
275 aa  95.1  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
277 aa  94.7  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
274 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
284 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  30.88 
 
 
274 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>