More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2159 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  100 
 
 
230 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  81.17 
 
 
231 aa  367  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  83.87 
 
 
235 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  84.43 
 
 
235 aa  363  2e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  80.56 
 
 
233 aa  358  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  80.56 
 
 
233 aa  357  6e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  80.56 
 
 
233 aa  357  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  73.48 
 
 
232 aa  346  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  75.33 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  76.47 
 
 
228 aa  325  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  74.89 
 
 
230 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  74.89 
 
 
230 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  74.89 
 
 
230 aa  323  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  74.89 
 
 
230 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  73.99 
 
 
231 aa  317  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  73.99 
 
 
231 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  73.99 
 
 
231 aa  317  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  73.54 
 
 
231 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  76.42 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  76.42 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  76.42 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  76.42 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  76.42 
 
 
231 aa  311  5.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  67.73 
 
 
228 aa  309  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  66.97 
 
 
230 aa  305  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  67.12 
 
 
230 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  66.06 
 
 
230 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  68.1 
 
 
263 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  65.47 
 
 
232 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  65.47 
 
 
232 aa  292  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
231 aa  291  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  291  6e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  291  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  65.02 
 
 
232 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  65.28 
 
 
231 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  62.07 
 
 
232 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  64.13 
 
 
232 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  65.89 
 
 
232 aa  288  4e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  67.32 
 
 
218 aa  286  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  64.25 
 
 
231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  64.49 
 
 
232 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  60.43 
 
 
232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  64.79 
 
 
232 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  63.08 
 
 
236 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  58.65 
 
 
230 aa  254  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  58.11 
 
 
230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  56.22 
 
 
233 aa  241  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  53.6 
 
 
230 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  57.82 
 
 
255 aa  237  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  55.02 
 
 
243 aa  234  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  55.24 
 
 
228 aa  231  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  53.36 
 
 
238 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  57.35 
 
 
236 aa  225  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  52.51 
 
 
228 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  51.18 
 
 
231 aa  218  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  51.85 
 
 
244 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  51.4 
 
 
237 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  49.54 
 
 
244 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  49.54 
 
 
244 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  53.81 
 
 
238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  51.92 
 
 
235 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  52.11 
 
 
225 aa  208  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  50.68 
 
 
238 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  50.45 
 
 
239 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  51.92 
 
 
214 aa  205  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  51.1 
 
 
236 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.88 
 
 
222 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  54.81 
 
 
228 aa  201  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  49.53 
 
 
202 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  46.73 
 
 
230 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.53 
 
 
231 aa  194  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1635  electron transport complex RsxE subunit  53.74 
 
 
239 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  46.95 
 
 
200 aa  191  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  46.95 
 
 
200 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.54 
 
 
216 aa  189  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  45.32 
 
 
224 aa  189  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  43.84 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.81 
 
 
226 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  44.34 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  49.28 
 
 
204 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.95 
 
 
235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  46.67 
 
 
200 aa  181  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  49.49 
 
 
239 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2433  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.23 
 
 
218 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109684  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  42.99 
 
 
200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  43.26 
 
 
201 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.55 
 
 
205 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  45.02 
 
 
223 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  46.31 
 
 
196 aa  170  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.15 
 
 
206 aa  169  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  44.13 
 
 
225 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.96 
 
 
253 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1381  electron transport complex RsxE subunit  40.74 
 
 
203 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000108717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  42.79 
 
 
239 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  45.89 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  41.71 
 
 
224 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0985  electron transport complex RsxE subunit  45.71 
 
 
201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>