More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2148 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01868  fused L-arabinose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.97097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  85.4 
 
 
507 aa  879  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01857  hypothetical protein  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.974378  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00548515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2131  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.2 
 
 
504 aa  840  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00340592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2636  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  4.58478e-11 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  82.77 
 
 
511 aa  852  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  5.48441e-07 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1884  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.69 
 
 
523 aa  840  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  85.8 
 
 
507 aa  885  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1024  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81 
 
 
504 aa  839  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1286  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.2 
 
 
504 aa  840  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00939133  hitchhiker  1.20675e-07 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  100 
 
 
507 aa  1035  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1735  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2262  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.5 
 
 
523 aa  838  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1743  ABC transporter related protein  81 
 
 
504 aa  839  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.50451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1998  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81.69 
 
 
523 aa  840  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  81 
 
 
504 aa  835  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.74587  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  89.66 
 
 
506 aa  921  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  59.64 
 
 
507 aa  603  1e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 
507 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4140  L-arabinose transporter ATP-binding protein  59.15 
 
 
514 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2614  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
504 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.383886  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 
511 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.58 
 
 
511 aa  558  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.09 
 
 
516 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429295  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3704  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.98 
 
 
503 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0547  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
503 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0138907  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3410  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.89 
 
 
512 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0659281  normal  0.140224 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0622  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
503 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0518663  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0590  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
503 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164103  normal  0.0495673 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0139  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.18 
 
 
503 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 
519 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.76 
 
 
520 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.92 
 
 
511 aa  541  1e-152  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2763  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.11 
 
 
520 aa  539  1e-152  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691602  normal  0.315971 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3447  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.33 
 
 
503 aa  540  1e-152  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1180  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.53 
 
 
503 aa  541  1e-152  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.38 
 
 
515 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 
503 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3483  L-arabinose transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 
503 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
522 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2485  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
515 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
515 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  54.19 
 
 
515 aa  531  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0405  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.582822  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1265  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3300  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
503 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
514 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0523  L-arabinose transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
487 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  53.35 
 
 
525 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4218  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.22 
 
 
520 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.231533  normal  0.845406 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.75 
 
 
497 aa  515  1e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3009  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.17 
 
 
509 aa  516  1e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 
509 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  52.34 
 
 
515 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  49.8 
 
 
508 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 
501 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  47.48 
 
 
501 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 
501 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  47.15 
 
 
494 aa  441  1e-122  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  45.6 
 
 
501 aa  440  1e-122  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.29 
 
 
513 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.08 
 
 
513 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.55 
 
 
499 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  46.57 
 
 
516 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.47 
 
 
496 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  45.36 
 
 
525 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
498 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  45.55 
 
 
505 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.65 
 
 
524 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.94 
 
 
516 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.86 
 
 
524 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
527 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.42 
 
 
524 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 
506 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.86 
 
 
524 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  44.6 
 
 
511 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.68 
 
 
514 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  43.27 
 
 
500 aa  421  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  44.83 
 
 
520 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.22 
 
 
524 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  44.42 
 
 
495 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  45.36 
 
 
500 aa  420  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  45.53 
 
 
507 aa  416  1e-115  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.2 
 
 
507 aa  416  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  45.49 
 
 
515 aa  418  1e-115  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 
523 aa  417  1e-115  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  43.29 
 
 
495 aa  418  1e-115  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.24 
 
 
524 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  45.86 
 
 
524 aa  415  1e-115  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  45.09 
 
 
519 aa  416  1e-115  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.29 
 
 
506 aa  416  1e-115  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.27 
 
 
518 aa  416  1e-115  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.11 
 
 
494 aa  418  1e-115  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  8.1797e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 
515 aa  414  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  45.4 
 
 
502 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  45.1 
 
 
517 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  43.99 
 
 
507 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.89 
 
 
497 aa  415  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>