More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2113 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  48.29 
 
 		 205 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  47.83 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  40.89 
 
 		 207 aa  130  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 208 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
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NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 234 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.15 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
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NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.35 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
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NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30.05 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
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NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.29 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  33.14 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
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NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
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NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.34 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
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NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
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NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  29.09 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.17 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.32 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 215 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 213 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
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NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  31.03 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
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