More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1984 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  76.86 
 
 
514 aa  765    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  84.74 
 
 
518 aa  877    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  73.14 
 
 
519 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  85.32 
 
 
518 aa  854    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
517 aa  1036    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  72.89 
 
 
518 aa  751    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  73.39 
 
 
519 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  86.41 
 
 
517 aa  882    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  73.39 
 
 
519 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  73.39 
 
 
519 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  77.86 
 
 
514 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  76.86 
 
 
514 aa  765    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  73.39 
 
 
519 aa  740    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  74.61 
 
 
516 aa  752    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  76.86 
 
 
522 aa  766    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  74.71 
 
 
518 aa  755    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  59.23 
 
 
530 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  55.25 
 
 
510 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  55.34 
 
 
518 aa  550  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4207  Integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
526 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110705  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4317  Integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
526 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.67976 
 
 
-
 
NC_003296  RS05062  hypothetical protein  55.15 
 
 
526 aa  521  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  54.46 
 
 
523 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  54.91 
 
 
523 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  54.72 
 
 
523 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  54.14 
 
 
523 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3379  integral membrane protein TerC  54.69 
 
 
530 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  52.11 
 
 
518 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  51.15 
 
 
522 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  51.82 
 
 
522 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  51.27 
 
 
518 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  51.08 
 
 
522 aa  481  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  55.47 
 
 
518 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  52.96 
 
 
515 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2870  integral membrane protein TerC  54.31 
 
 
522 aa  477  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  53.94 
 
 
515 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  51.66 
 
 
522 aa  465  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  48.97 
 
 
577 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  50.66 
 
 
528 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0880  integral membrane protein  48.91 
 
 
527 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000917875  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  48.78 
 
 
528 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  50.09 
 
 
528 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  50.09 
 
 
528 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  50.09 
 
 
528 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  49.52 
 
 
527 aa  455  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  48.29 
 
 
529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01969  fused predicted membrane protein/predicted membrane protein  49.33 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0999  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.13 
 
 
527 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1594  Integral membrane protein TerC  49.13 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12256  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2356  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.33 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01958  hypothetical protein  49.33 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1169  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.33 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0452  TerC family membrane protein  51.46 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.789805  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1578  integral membrane protein TerC  49.13 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  47.83 
 
 
529 aa  440  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2998  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.33 
 
 
527 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.159646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1066  Integral membrane protein TerC  52.25 
 
 
513 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0348  Integral membrane protein TerC  42.22 
 
 
527 aa  326  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 
250 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 
250 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 
250 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  51.81 
 
 
250 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  51.01 
 
 
254 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  53.44 
 
 
253 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  56.47 
 
 
253 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  50.84 
 
 
251 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 
248 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 
247 aa  248  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  52.5 
 
 
239 aa  249  1e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  48.95 
 
 
241 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  51.41 
 
 
250 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  51.91 
 
 
249 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
251 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
251 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  60.09 
 
 
255 aa  247  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 
250 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  51.54 
 
 
271 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 
252 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1232  integral membrane protein TerC  50.42 
 
 
251 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140437  normal  0.537044 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  52.21 
 
 
257 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  49.38 
 
 
246 aa  242  9e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1139  integral membrane protein TerC  50 
 
 
267 aa  242  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  56.6 
 
 
258 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  49.57 
 
 
249 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
295 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1151  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
251 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.337548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  52.86 
 
 
249 aa  240  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  51.98 
 
 
250 aa  240  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  48.95 
 
 
252 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  51.68 
 
 
249 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 
251 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1664  hypothetical protein  52.54 
 
 
247 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.898463  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5520  integral membrane protein TerC  51.1 
 
 
274 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350667  normal  0.0618236 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>