41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1948 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2176  Oligogalacturonide lyase  88.89 
 
 		 388 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00249856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1884  Oligogalacturonide lyase  88.63 
 
 		 388 aa  733    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00177498  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1948  Oligogalacturonide lyase  100 
 
 		 388 aa  815    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000264473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2056  Oligogalacturonide lyase  92.01 
 
 		 388 aa  763    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00529554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1792  oligogalacturonide lyase  79.64 
 
 		 388 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.512963  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2654  oligogalacturonate lyase  79.38 
 
 		 388 aa  676    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.619254  normal  0.0112854 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1682  oligogalacturonide lyase  79.64 
 
 		 388 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3297  oligogalacturonide lyase  68.49 
 
 		 391 aa  575  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.367487  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000912  oligogalacturonate lyase  67.79 
 
 		 385 aa  571  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3293  oligogalacturonide lyase  65.26 
 
 		 375 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0773  oligogalacturonide lyase  57.85 
 
 		 382 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2370  oligogalacturonide lyase  30.58 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.612375 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3901  hypothetical protein  27.52 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0134044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0273  hypothetical protein  23.44 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.738007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2448  hypothetical protein  25.18 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.317121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.11 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  26.01 
 
 		 441 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  24.28 
 
 		 451 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.34 
 
 		 716 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  26.28 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  24.29 
 
 		 442 aa  46.6  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1898  translocation protein TolB  24.22 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  23.94 
 
 		 424 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.59 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  22.6 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  27.17 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  20.5 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  24.06 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1331  WD40 domain-containing protein  25.58 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  25.45 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  25.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.39 
 
 		 407 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 440 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  24.86 
 
 		 439 aa  42.7  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  25.79 
 
 		 430 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  25.81 
 
 		 443 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  25.67 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  24.24 
 
 		 443 aa  42.7  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  24.85 
 
 		 421 aa  42.7  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>