More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1866 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1866  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 		 495 aa  1000    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1783  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  88.41 
 
 		 501 aa  887    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.26432  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  78.86 
 
 		 497 aa  778    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  79.88 
 
 		 497 aa  788    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  62.53 
 
 		 501 aa  604  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  62.74 
 
 		 501 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  62.53 
 
 		 501 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  62.17 
 
 		 488 aa  599  1e-170  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  57.09 
 
 		 499 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  47.82 
 
 		 501 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0835  GntR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 501 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.255171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3365  transcriptional regulator  48.26 
 
 		 503 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5048  transcriptional regulator  51.8 
 
 		 502 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4852  transcriptional regulator  47.98 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5360  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3006  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4910  transcriptional regulator  48.26 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4619  transcriptional regulator  45.26 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.232866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0281  GntR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 503 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5240  transcriptional regulator  47.95 
 
 		 502 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2171  GntR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 507 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  46 
 
 		 515 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4710  GntR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 502 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 509 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2128  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1478.1  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4666  transcriptional regulator  47.36 
 
 		 511 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0495  transcriptional regulator  46.51 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885427  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0811  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 564 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.482303  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3610  transcriptional regulator  47.34 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 569 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4449  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3917  GntR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  46.49 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2118  GntR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0506592  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3811  transcriptional regulator  46.93 
 
 		 507 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3295  GntR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 507 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.761418 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0397  transcriptional regulator  46.51 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1824  GntR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 564 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0030  putative transcription regulator protein  45.67 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3720  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.36 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3397  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  44.62 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2866  GntR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 492 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156549  normal  0.161976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2382  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.2 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0552603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0348  GntR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 495 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0423  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  43.1 
 
 		 494 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1152  GntR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 492 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 496 aa  353  5e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5427  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 490 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491975  normal  0.163691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3858  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.5 
 
 		 491 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3639  transcriptional regulator  39.92 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4478  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3888  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 488 aa  339  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.490049  normal  0.865641 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7128  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.7 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  41.23 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 492 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  41 
 
 		 492 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4112  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 495 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0246  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 507 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 498 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 502 aa  323  5e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  40 
 
 		 502 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 511 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1693  GntR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 492 aa  318  1e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0044  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1910  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.65 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.279247  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0937  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 486 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  39.96 
 
 		 502 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  41.83 
 
 		 488 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 490 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  37.42 
 
 		 500 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4139  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 503 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.5231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10010  putative transcriptional regulator  38.19 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  37.34 
 
 		 485 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2817  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 487 aa  302  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.151028  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2304  regulatory protein GntR, HTH  36.55 
 
 		 475 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3840  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.93 
 
 		 499 aa  297  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3519  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.89 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.84 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0986  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.82 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 485 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0609  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  35.62 
 
 		 514 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3668  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  36.48 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.271515  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4136  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.53433  normal  0.112546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>