281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1850 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01201  nitrate/nitrite transporter  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2422  nitrite transporter  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0235943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01211  hypothetical protein  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.853589  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2898  nitrite transporter  75.7 
 
 		 462 aa  666    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1391  nitrite extrusion protein 1  73.87 
 
 		 463 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00798499  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1374  nitrite extrusion protein 1  74.03 
 
 		 461 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0787741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2316  nitrite transporter  72.14 
 
 		 465 aa  655    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.95434  normal  0.769623 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1558  nitrite extrusion protein 1  73.28 
 
 		 465 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.431226  normal  0.0433169 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1333  nitrite extrusion protein 1  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000558307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1960  nitrite extrusion protein 1  73.96 
 
 		 465 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0440291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1768  nitrite transporter  89.63 
 
 		 468 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2260  nitrite transporter  76.62 
 
 		 462 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2400  nitrite transporter  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2566  nitrite transporter  76.74 
 
 		 462 aa  679    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1916  nitrite extrusion protein 1  74.08 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184588  normal  0.196505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1375  nitrite extrusion protein 1  73.28 
 
 		 465 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1896  nitrite extrusion protein 1  73.28 
 
 		 465 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0112468  normal  0.326955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1901  nitrite extrusion protein 1  73.28 
 
 		 465 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0276869  normal  0.947736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1850  nitrite transporter  100 
 
 		 463 aa  915    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1707  nitrite extrusion protein 1  73.87 
 
 		 463 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2061  nitrite transporter  70.86 
 
 		 463 aa  613  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2225  nitrite transporter  67.03 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190366  normal  0.0765968 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2301  nitrite transporter  67.03 
 
 		 472 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.123404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01427  nitrate/nitrite transporter  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2178  nitrite transporter  69.18 
 
 		 462 aa  599  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2187  nitrite transporter  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.74785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1553  nitrite extrusion protein 2  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.615088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1693  nitrite extrusion protein 2  71.33 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.584294 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2079  nitrite extrusion protein 2  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1754  nitrite extrusion protein 2  71.33 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.495939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01439  hypothetical protein  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1705  nitrite extrusion protein 2  69.4 
 
 		 462 aa  600  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0635768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1766  nitrite extrusion protein 2  71.33 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.408584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1691  nitrite extrusion protein 2  71.33 
 
 		 462 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1650  nitrite extrusion protein 2  69.18 
 
 		 462 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1585  nitrite extrusion protein 2  71.11 
 
 		 466 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1233  nitrite extrusion protein 2  58.19 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13770  nitrite extrusion protein 2  57.96 
 
 		 468 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.45404 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5001  nitrate transporter  54.07 
 
 		 461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0909431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0334  nitrate transporter  52.04 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000163846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2237  nitrite transporter  53.53 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.532951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3863  major facilitator transporter  52.99 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0604  MFS nitrate/nitrite transporter NarK  52.35 
 
 		 459 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2073  nitrate transporter  54.82 
 
 		 460 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741347  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1775  nitrite transporter  51.54 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2174  nitrate transporter  51.79 
 
 		 475 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.642939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1704  nitrite transporter  51.67 
 
 		 475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0932912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0665  nitrite transporter  51.34 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  51.75 
 
 		 905 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2657  nitrite transporter  52.98 
 
 		 457 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6183  cyclic nucleotide-binding protein  51.97 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0259908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1855  nitrate/nitrite transporter NarK  53.41 
 
 		 461 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  51.79 
 
 		 893 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2755  nitrate/nitrite transporter NarK  53.19 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2623  nitrite extrusion protein  53.19 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2679  nitrite extrusion protein  53.19 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1730  nitrate/nitrite transporter NarK  52.97 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3079  nitrite extrusion protein  52.97 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  47.85 
 
 		 912 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0208  nitrite transporter  53.11 
 
 		 457 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1512  nitrite extrusion protein  52.97 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.85958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2240  nitrite extrusion protein  52.97 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.452276  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0973  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  51.95 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.939633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3590  nitrite transporter  51.96 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.494502  normal  0.38481 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4667  nitrite transporter  51.96 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.885517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  48.28 
 
 		 895 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0660  nitrite transporter  52.68 
 
 		 487 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1108  nitrite transporter  51.51 
 
 		 486 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0426  nitrite transporter  49.26 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  49.89 
 
 		 917 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0435  nitrite transporter  49.05 
 
 		 481 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1709  NO3-/NO2- ABC transporter  45.58 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  51.87 
 
 		 699 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0349  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2802  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 476 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5927  nitrite extrusion protein  46.31 
 
 		 440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0123959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1268  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 470 aa  325  8.000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0770735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1313  major facilitator superfamily MFS_1  43.17 
 
 		 491 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000040275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2725  major facilitator superfamily MFS_1  43.79 
 
 		 457 aa  323  6e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.0909618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1769  major facilitator superfamily MFS_1  40.82 
 
 		 475 aa  315  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00234233  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3865  nitrite transporter  41.74 
 
 		 455 aa  312  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4255  nitrite transporter  42.6 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.823889  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10271  integral membrane nitrite extrusion protein narU (nitrite facilitator)  40.53 
 
 		 463 aa  310  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0502374 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2362  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 458 aa  303  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.165332  normal  0.523677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1330  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2417  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 		 467 aa  300  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000388918  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3492  nitrite transporter  39.66 
 
 		 467 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1822  major facilitator superfamily MFS_1  40.54 
 
 		 440 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.679534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0837  major facilitator superfamily MFS_1  40.13 
 
 		 450 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6173  major facilitator superfamily MFS_1  36.99 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2166  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 461 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.203269  normal  0.0459407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3137  nitrate/nitrite antiporter  31.8 
 
 		 530 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.411824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2247  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00033016  normal  0.289555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1495  major facilitator transporter  36.33 
 
 		 464 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.078624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3044  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 		 461 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0440547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4596  nitrate/nitrite antiporter  33.16 
 
 		 552 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0245  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.205061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1315  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 460 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.629045  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1710  nitrate/nitrite antiporter  34.15 
 
 		 552 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.464257  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3015  nitrite extrusion protein  34.32 
 
 		 484 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.35043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>