73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1809 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1809  late control D family protein  100 
 
 		 391 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000332404  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2105  late control D family protein  54 
 
 		 401 aa  438  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0758552  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4389  late control gene D protein  43.41 
 
 		 389 aa  315  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.725346  normal  0.0652944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3476  phage late control D family protein  42.23 
 
 		 387 aa  312  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.216601  normal  0.122645 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0998  phage late control gene D protein  44.68 
 
 		 387 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.780637  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4351  phage late control gene D protein  44.15 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3024  phage late control gene D protein  44.41 
 
 		 387 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.051519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3198  late control D family protein  41.32 
 
 		 382 aa  296  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000789216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2352  late control D family protein  43.41 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.065296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2193  late control gene D protein  42.82 
 
 		 364 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2305  late control D family protein  42.58 
 
 		 364 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0857  late control D family protein  38.95 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149579  hitchhiker  0.00128029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2842  phage late control D family protein  39.73 
 
 		 366 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3025  phage late control D family protein  39.47 
 
 		 366 aa  276  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1359  phage late control D family protein  40.61 
 
 		 366 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0948  phage late control gene D protein  40.35 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.210048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2487  phage late control gene D protein  40.63 
 
 		 366 aa  271  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  40.06 
 
 		 366 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2665  late control D family protein  40.32 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.132861  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2889  late control D family protein  37.99 
 
 		 375 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1912  hypothetical protein  37.26 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0970485  normal  0.714106 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4862  late control D family protein  37 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0171627  normal  0.29405 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0179  late control D family protein  36.7 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3315  phage late control D family protein  37.25 
 
 		 344 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01338  bacteriophage P2 gpD protein  34.26 
 
 		 328 aa  216  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1325  fels-2 prophage protein  35.47 
 
 		 366 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.370429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1372  phage late control D  33.99 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.475376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2620  late control D family protein  34.27 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000538396  hitchhiker  0.00000000174337 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2586  late control D family protein  34.27 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000462859  hitchhiker  0.00000849595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37340  Phage late control gene D protein-like protein  32.75 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08150  putative phage late control gene D protein  29.13 
 
 		 329 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000948229  hitchhiker  0.000300765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1854  phage late control D family protein  26.18 
 
 		 349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.491572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1218  late control D family protein  26.33 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.868183  hitchhiker  0.000188343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32130  Phage late control D protein  29.55 
 
 		 274 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3390  tail protein D  26.05 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3065  pyocin R2_PP, tail formation  26.33 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.561868  normal  0.32013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0772  tail protein D  27.02 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.325808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1918  pyocin R2_PP, tail formation  27.83 
 
 		 350 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0753  phage late control gene D protein GPD  27.65 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.514992  normal  0.317434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3318  phage late control D  27.98 
 
 		 361 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0881  late control D family protein  26.94 
 
 		 357 aa  109  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0986779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3003  phage late control D family protein  28.45 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1623  phage-related tail protein  26.5 
 
 		 325 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3359  Phage tail protein D  27.31 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2045  late control D family protein  27.99 
 
 		 373 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2371  phage late control D  27.38 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1151  Phage protein D-like  36.08 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0185813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4034  late control D family protein  28.37 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.356651  unclonable  0.0000000000000337876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0700  Phage protein D-like  25.14 
 
 		 328 aa  90.1  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1130  phage-related tail protein  23.32 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0391  phage-related tail protein  23.32 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1152  late control D family protein  23.32 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0567  prophage P2W3, tail protein D, putative  21.83 
 
 		 314 aa  88.6  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1278  phage late control D  25.34 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1572  late control D family protein  26.65 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00850  putative regulator of late gene expression  42.42 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00856  hypothetical protein  42.42 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2890  late control D family protein  24.46 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.198906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2289  phage late control D family protein  24.78 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.775888  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0254  tail protein D, putative  24.65 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4462  gp21  27.78 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2678  putative tail protein  45.45 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705828  normal  0.016098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4546  gp47  26.67 
 
 		 347 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4547  gp47  26.67 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.92987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2506  phage late control D family protein  24.41 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2347  hypothetical protein  24.06 
 
 		 337 aa  68.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0628868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0698  late control D family protein  22.76 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2911  prophage MuMc02, late control gene D protein, putative  28.92 
 
 		 347 aa  67  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02002  hypothetical protein  29.19 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4910  late control D family protein  22.83 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.642723 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1485  phage late control D family protein  22.71 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0928  Phage protein D-like protein  26.53 
 
 		 362 aa  46.6  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1216  phage late control D family protein  21.9 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>