43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1780 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1826  hypothetical protein  42.3 
 
 
878 aa  683    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1468  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1566  hypothetical protein  40.24 
 
 
879 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2599  hypothetical protein  47.85 
 
 
870 aa  828    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2213  hypothetical protein  47.44 
 
 
898 aa  779    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1919  hypothetical protein  47.32 
 
 
904 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2274  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  649    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1770  hypothetical protein  40.24 
 
 
879 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.930224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1619  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1763  hypothetical protein  42.42 
 
 
878 aa  687    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0322713 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2264  conserved hypothetical protein  40.24 
 
 
879 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0095574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1766  hypothetical protein  42.18 
 
 
878 aa  684    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.916643  normal  0.0307934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1510  hypothetical protein  42.3 
 
 
878 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1693  hypothetical protein  42.3 
 
 
878 aa  685    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2003  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  646    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01366  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  648    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1780  hypothetical protein  100 
 
 
867 aa  1725    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2291  hypothetical protein  53.92 
 
 
863 aa  912    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0813621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2591  hypothetical protein  52.57 
 
 
863 aa  899    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01353  hypothetical protein  40 
 
 
879 aa  648    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1809  hypothetical protein  47.44 
 
 
910 aa  779    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1943  hypothetical protein  40.81 
 
 
879 aa  684    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00013464  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35270  hypothetical protein  22.88 
 
 
863 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786077  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2186  hypothetical protein  25.58 
 
 
1066 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.222967  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2166  hypothetical protein  27.27 
 
 
1307 aa  52.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3336  hypothetical protein  23.23 
 
 
860 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.658956  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1845  hypothetical protein  25.58 
 
 
1068 aa  52  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.725746  normal  0.580829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1791  hypothetical protein  25.58 
 
 
1070 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.684722  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1481  hypothetical protein  24.51 
 
 
1100 aa  50.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.342651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2064  hypothetical protein  24.86 
 
 
1086 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2187  hypothetical protein  24.42 
 
 
1108 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2110  hypothetical protein  26.01 
 
 
1222 aa  48.5  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2545  hypothetical protein  22.22 
 
 
1120 aa  48.1  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.960719  normal  0.0399031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6081  hypothetical protein  25.48 
 
 
847 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.82344  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1924  hypothetical protein  22.22 
 
 
1164 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787497  normal  0.0260112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2427  hypothetical protein  22.22 
 
 
1154 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0924938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2434  hypothetical protein  22.22 
 
 
1148 aa  47.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.491363  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70070  hypothetical protein  24.84 
 
 
854 aa  47.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2136  hypothetical protein  22.52 
 
 
863 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.233841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1636  hypothetical protein  26.16 
 
 
1058 aa  45.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0361894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2698  hypothetical protein  27.43 
 
 
1205 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737361  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1849  hypothetical protein  27.33 
 
 
1104 aa  44.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1914  hypothetical protein  26.88 
 
 
1134 aa  44.3  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167412  normal  0.675287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>