61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1684 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1684  protein of unknown function DUF330  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1653  protein of unknown function DUF330  67.43 
 
 
185 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2068  protein of unknown function DUF330  52.72 
 
 
188 aa  185  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1747  hypothetical protein  53.89 
 
 
185 aa  184  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00777543  decreased coverage  3.70009e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0367  hypothetical protein  53.26 
 
 
182 aa  182  2e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1795  hypothetical protein  51.37 
 
 
188 aa  182  2e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.309895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4854  hypothetical protein  53.26 
 
 
182 aa  182  2e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1991  putative lipoprotein  50 
 
 
192 aa  172  2e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2548  putative lipoprotein  49.47 
 
 
192 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00417943  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2637  hypothetical protein  49.47 
 
 
192 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.2573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1464  hypothetical protein  47.03 
 
 
188 aa  168  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.57242e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1067  hypothetical protein  47.85 
 
 
187 aa  161  5e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.85697e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1061  hypothetical protein  47.85 
 
 
187 aa  161  5e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.40203e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2691  protein of unknown function DUF330  47.85 
 
 
187 aa  161  5e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.27636e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2644  hypothetical protein  47.85 
 
 
187 aa  161  5e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.51515e-06  hitchhiker  2.97897e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2365  putative lipoprotein  47.31 
 
 
187 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0264734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1116  putative lipoprotein  47.31 
 
 
187 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.2581e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2167  putative lipoprotein  47.31 
 
 
187 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.82452e-07  normal  0.394753 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00963  hypothetical protein  48.86 
 
 
182 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.61465e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00956  hypothetical protein  48.86 
 
 
182 aa  158  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.76204e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1106  putative lipoprotein  45.16 
 
 
187 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  0.0111053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1023  putative lipoprotein  45.16 
 
 
187 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.48477e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1128  putative lipoprotein  45.16 
 
 
187 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000973487  normal  0.73613 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1174  hypothetical protein  45.16 
 
 
187 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00770681  normal  0.496959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1140  putative lipoprotein  44.62 
 
 
187 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000741069  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2009  hypothetical protein  39.6 
 
 
221 aa  101  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02852  hypothetical protein  36.32 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2723  hypothetical protein  34.87 
 
 
211 aa  94.4  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1921  hypothetical protein  32.5 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003027  putative lipoprotein  30.27 
 
 
192 aa  82  4e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2112  hypothetical protein  32.09 
 
 
197 aa  80.1  2e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.178277  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1866  hypothetical protein  31.55 
 
 
197 aa  78.6  5e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1353  putative lipoprotein  31.82 
 
 
192 aa  70.1  2e-11  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  1.61061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1055  protein of unknown function DUF330  31.09 
 
 
198 aa  65.1  5e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02657  hypothetical protein  26.67 
 
 
202 aa  62.8  3e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2931  hypothetical protein  26.63 
 
 
198 aa  58.5  5e-08  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0667  hypothetical protein  28.04 
 
 
211 aa  57.8  9e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4087  hypothetical protein  27.62 
 
 
188 aa  57.4  1e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00226644  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2417  hypothetical protein  27.42 
 
 
204 aa  57  1e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0242841  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2448  hypothetical protein  26.97 
 
 
201 aa  50.1  2e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.136482  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0231  hypothetical protein  20.74 
 
 
241 aa  49.3  3e-05  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2075  hypothetical protein  24.16 
 
 
191 aa  48.5  5e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00929812  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0230  hypothetical protein  21.38 
 
 
241 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3139  hypothetical protein  32.08 
 
 
200 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0226  hypothetical protein  27.54 
 
 
238 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2220  protein of unknown function DUF330  24.86 
 
 
197 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.2506e-07 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0041  protein of unknown function DUF330  31.54 
 
 
197 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0364  putative lipoprotein  28.11 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14709  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1703  hypothetical protein  22.8 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2001  protein of unknown function DUF330  24.29 
 
 
196 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0601  hypothetical protein  26.35 
 
 
242 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.391552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3241  protein of unknown function DUF330  26.2 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2634  hypothetical protein  21.46 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0677  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204159  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5507  hypothetical protein  26.11 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44160  hypothetical protein  27.89 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266274  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0710  hypothetical protein  26.35 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0652  hypothetical protein  25.82 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.049729  normal  0.69496 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3798  hypothetical protein  26.35 
 
 
240 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.860154  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0710  protein of unknown function DUF330  25 
 
 
248 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3500  hypothetical protein  30.19 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>