172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1613 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  100 
 
 		 347 aa  721    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  83.48 
 
 		 349 aa  617  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2513  dihydroorotase  80.64 
 
 		 347 aa  600  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.983589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  80.64 
 
 		 347 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1896  dihydroorotase  76.59 
 
 		 348 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0828731  hitchhiker  0.000136895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1567  dihydroorotase  76.01 
 
 		 348 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0106097  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0402  dihydroorotase  76.01 
 
 		 348 aa  569  1e-161  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0202499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1675  dihydroorotase  76.01 
 
 		 348 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1185  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01058  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2584  dihydroorotase, homodimeric type  69.65 
 
 		 348 aa  521  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.820895  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2538  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.223191  normal  0.326474 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01066  hypothetical protein  69.36 
 
 		 348 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1441  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.426148  normal  0.0213207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2265  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2067  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863228  normal  0.103848 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1185  dihydroorotase  69.65 
 
 		 348 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2025  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2209  dihydroorotase  69.65 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194064  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1231  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.905188  normal  0.395002 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1576  dihydroorotase  69.36 
 
 		 348 aa  516  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1275  dihydroorotase  69.08 
 
 		 348 aa  514  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.78408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1260  dihydroorotase  69.08 
 
 		 348 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.374418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3231  dihydroorotase  66.28 
 
 		 351 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0441  dihydroorotase  62.25 
 
 		 364 aa  472  1e-132  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.373493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0935  dihydroorotase  62.06 
 
 		 346 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1427  dihydroorotase  61.42 
 
 		 340 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  59.94 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  59.71 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  56.85 
 
 		 346 aa  428  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  57.51 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  57.51 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  57.51 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  58.65 
 
 		 344 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  58.67 
 
 		 346 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  57.23 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  56.94 
 
 		 354 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  59.53 
 
 		 343 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  57.51 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  57.86 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  57.57 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  57.52 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  58.41 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  56.77 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  57.82 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  58.53 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2371  dihydroorotase  58.36 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.860009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  57.23 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  58.16 
 
 		 359 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  57.27 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  57.06 
 
 		 352 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  56.77 
 
 		 352 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  56.64 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  55.98 
 
 		 355 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  58.75 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  57.18 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  57.18 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  57.23 
 
 		 343 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  58.6 
 
 		 345 aa  413  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  57.18 
 
 		 347 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  57.91 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  58.75 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  57.91 
 
 		 350 aa  411  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  56.3 
 
 		 343 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  57.57 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  57.57 
 
 		 347 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3761  dihydroorotase  58.6 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.793108  hitchhiker  0.00208859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  56.07 
 
 		 352 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  57.1 
 
 		 355 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  56.93 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  57.65 
 
 		 348 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  56.64 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1776  dihydroorotase  55.72 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.130496  normal  0.212063 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  56.47 
 
 		 345 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  57.18 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18131  dihydroorotase  56.82 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.085007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  55.59 
 
 		 348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  56.73 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  56.89 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3215  dihydroorotase  58.31 
 
 		 345 aa  401  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  56.52 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06241  dihydroorotase  53.78 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  56.89 
 
 		 343 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  57.18 
 
 		 343 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0129  dihydroorotase  55.72 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.969204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  56.93 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3595  dihydroorotase  57.73 
 
 		 344 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0005  dihydroorotase  53.78 
 
 		 354 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  56.05 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  54.09 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  54.39 
 
 		 353 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  56.3 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  54.81 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0524  dihydroorotase  56.3 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  56.01 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  54.84 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>