44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1596 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1596  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000160674  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2864  hypothetical protein  94.31 
 
 
212 aa  410  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0184645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2558  hypothetical protein  93.36 
 
 
212 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1562  hypothetical protein  96.23 
 
 
212 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0491  hypothetical protein  72.04 
 
 
211 aa  327  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2387  hypothetical protein  65.4 
 
 
213 aa  305  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000400557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1905  hypothetical protein  63.21 
 
 
212 aa  292  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3034  hypothetical protein  59.05 
 
 
217 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3514  hypothetical protein  58.1 
 
 
212 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.994561  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0231  hypothetical protein  59.24 
 
 
213 aa  258  7e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000920  ribose 5-phosphate isomerase  54.72 
 
 
211 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1188  hypothetical protein  53.77 
 
 
212 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000157328  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2094  hypothetical protein  53.77 
 
 
212 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  hitchhiker  5.6242699999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2148  hypothetical protein  53.77 
 
 
212 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.484462  hitchhiker  2.8697e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1312  hypothetical protein  53.77 
 
 
212 aa  229  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000032652 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2095  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2490  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  226  3e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00174175  hitchhiker  0.0000400283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2088  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000131835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2204  hypothetical protein  53.3 
 
 
212 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.663487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0612  hypothetical protein  52.36 
 
 
212 aa  224  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0781  hypothetical protein  52.36 
 
 
211 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2483  hypothetical protein  51.89 
 
 
212 aa  221  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03282  hypothetical protein  49.71 
 
 
185 aa  188  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.26871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1068  ribose 5-phosphate isomerase RpiB  37.12 
 
 
139 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  29.73 
 
 
149 aa  58.5  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.36 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1019  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  33.33 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.485944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.5 
 
 
142 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  27.63 
 
 
145 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  29.25 
 
 
149 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1664  ribose 5-phosphate isomerase B  32.54 
 
 
143 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1737  ribose 5-phosphate isomerase B  32.54 
 
 
143 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  28.26 
 
 
149 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  26.55 
 
 
148 aa  45.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5073  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  29.2 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.11 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 
370 aa  44.7  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  30.99 
 
 
143 aa  43.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  34.78 
 
 
171 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  29.37 
 
 
144 aa  42  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  25.37 
 
 
149 aa  41.6  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.31 
 
 
142 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  29.11 
 
 
140 aa  41.6  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  29.79 
 
 
150 aa  41.6  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>