43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1482 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  100 
 
 
227 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0113  TriG protein  51.32 
 
 
228 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0043  TriG protein  43.42 
 
 
228 aa  198  7e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0097  pilx8 protein  40.68 
 
 
237 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0330769  normal  0.561395 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0176  cmgB8  31.34 
 
 
225 aa  108  6e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.579945  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6330  VirB8 family protein  34.09 
 
 
251 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0062  type IV secretion system protein VirB8  31.43 
 
 
239 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.622511  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0057  type IV secretion system protein VirB8  31.43 
 
 
239 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0036  cmgB8  33.5 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  32.02 
 
 
202 aa  85.5  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  30.29 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6500  VirB8 family protein  31.6 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  28.04 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1759  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  32.23 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0117754  normal  0.26092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1142  VirB8 family protein  31.72 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  27.19 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  27.4 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0866  VirB8 family protein  31.16 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2652  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  31.6 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0159035  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  27.57 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  28.64 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4848  VirB8  28.91 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  25.11 
 
 
238 aa  73.6  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3318  VirB8 family protein  28.91 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  27.56 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  26.76 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0453  putative type IV secretion system protein VirB8/TraJ  28.91 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0167  VirB8 family protein  28.44 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.42485 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  28.64 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4197  VirB8 family protein  28.91 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  0.861265 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  26.85 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  26.85 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  26.05 
 
 
223 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3526  type IV secretion system protein VirB8  23.72 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  27.91 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8221  type IV secretion system protein VirB8  29.03 
 
 
237 aa  55.5  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0004  type IV secretion system protein VirB8  26.04 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.2066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2448  VirB8 family protein  27.66 
 
 
351 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6155  type IV secretion system protein VirB8  27.96 
 
 
237 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.141854  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  26.13 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6211  VirB8 family protein  25.76 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0724347 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  25 
 
 
299 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0743  type IV secretion system protein VirB8  24.19 
 
 
225 aa  42  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.123986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>