144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1480 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  100 
 
 		 400 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  52.99 
 
 		 398 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  58.72 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  34.66 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  36.68 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  41.94 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  40.85 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  36.44 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  36.44 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  41.24 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  42.35 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  40.51 
 
 		 386 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  37.5 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  37.12 
 
 		 408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  42.25 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  38.14 
 
 		 390 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  40.93 
 
 		 396 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  37 
 
 		 492 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  36.13 
 
 		 484 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  37.37 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  33.2 
 
 		 381 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  34.2 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  36.27 
 
 		 373 aa  127  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  37.77 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  34.45 
 
 		 450 aa  119  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  36.04 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  33.5 
 
 		 380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  35.12 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  28.93 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  34.31 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  31.36 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  34.34 
 
 		 445 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  30.8 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  30.45 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  29.29 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  33 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  33.16 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  33.16 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  31.34 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  33.33 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 		 407 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  30.26 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  27.6 
 
 		 363 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  23.87 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  27.6 
 
 		 363 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  26.88 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  29.41 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  27.81 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  26.54 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  28.5 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  27.03 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  26.6 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  26.74 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  25.95 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  26.49 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  27.72 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1508  conjugal transfer protein trbI  24.65 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187408  normal  0.430522 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  26.27 
 
 		 466 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  26.84 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  28.88 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5455  conjugation TrbI-like protein  25.4 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  24.86 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0170  conjugation TrbI family protein  27.62 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.238278  normal  0.267939 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  25.95 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  26.23 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0895  conjugation TrbI family protein  28.46 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  26.11 
 
 		 402 aa  62.8  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2276  conjugation TrbI family protein  28.11 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.125244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  26.94 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  25.68 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  28.7 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  28.8 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  25.14 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  25.27 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  25.14 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  25 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  26.78 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1004  conjugation TrbI family protein  26.4 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3836  conjugation TrbI family protein  26.74 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  26.11 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0309  conjugation TrbI-like protein  24.5 
 
 		 398 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  28.8 
 
 		 469 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2511  conjugation TrbI family protein  27.75 
 
 		 490 aa  57  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26137  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2887  conjugation TrbI family protein  25.54 
 
 		 401 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.174381 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5007  conjugation TrbI family protein  26.55 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14472  normal  0.964803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2605  conjugation TrbI-like protein  25 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  25.75 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  25.75 
 
 		 403 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  26.9 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0740  conjugation TrbI family protein  25.54 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  21.07 
 
 		 457 aa  55.8  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  25.13 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  24.49 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  22.51 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5412  conjugation TrbI family protein  25.99 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.525455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3221  conjugation TrbI family protein  25.14 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0332063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1843  conjugation TrbI family protein  24.02 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.851946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0075  conjugal transfer protein TrbI  27.37 
 
 		 190 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766506  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  22.51 
 
 		 473 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>