102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1306 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1306  General secretion pathway protein K  100 
 
 
356 aa  732    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1477  General secretion pathway protein K  71.07 
 
 
345 aa  514  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.908273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2853  General secretion pathway protein K  49.86 
 
 
328 aa  323  3e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1419  General secretion pathway protein K  48.75 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0010  general secretion pathway protein K  39.72 
 
 
325 aa  227  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.199585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4351  general secretion pathway protein K  32.77 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.847648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4199  general secretion pathway protein K  33.89 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0160  General secretion pathway protein K  33.89 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0176  general secretion pathway protein K  32.96 
 
 
324 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.385  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0160  general secretion pathway protein K  33.89 
 
 
332 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0623809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0156  general secretion pathway protein K  33.89 
 
 
332 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0128  general secretion pathway protein K  34.75 
 
 
362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0112  general secretion pathway protein K  33.52 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0173  general secretion pathway protein K  32.49 
 
 
332 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0158  general secretion pathway protein K  32.49 
 
 
332 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.601674  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4727  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00608  general secretion pathway protein K  32.78 
 
 
336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0163  general secretion pathway protein K  32.21 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0158  general secretion pathway protein K  32.21 
 
 
332 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3612  general secretion pathway protein K  33.06 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0151  general secretion pathway protein K  30.92 
 
 
326 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001885  general secretion pathway protein K  31.49 
 
 
336 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3560  general secretion pathway protein K  33.24 
 
 
334 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2299  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4584  general secretion pathway protein K  34.16 
 
 
371 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2917  general secretion pathway protein K  32.96 
 
 
339 aa  153  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03963  putative general secretion pathway protein  29.53 
 
 
358 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0104  general secretion pathway protein K  29.4 
 
 
327 aa  135  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0238  general secretion pathway protein K  26.89 
 
 
334 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0381  General secretion pathway protein K  32.13 
 
 
327 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3526  general secretion pathway protein K  32.13 
 
 
327 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0381  general secretion pathway protein K  32.13 
 
 
327 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.61941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03183  general secretory pathway component, cryptic  31.8 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03134  hypothetical protein  31.8 
 
 
327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0388  general secretion pathway protein K  25.15 
 
 
333 aa  117  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.6574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02831  hypothetical type II secretion protein GspK  28.53 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000902301  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02781  hypothetical protein  30.26 
 
 
325 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000553793  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3131  general secretion pathway protein K  30.26 
 
 
325 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2036  general secretion pathway protein K  29.01 
 
 
333 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3420  general secretion pathway protein K  28.83 
 
 
325 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3240  general secretion pathway protein GspK  29.89 
 
 
325 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.656676  normal  0.626096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24070  general secretion pathway protein K  29.01 
 
 
333 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.211212  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1386  general secretion pathway protein K  29.33 
 
 
328 aa  104  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.729175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3573  general secretion pathway protein K  26.58 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.672104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2919  general secretion pathway protein K  29.41 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0845595 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1355  general secretion pathway protein K  29.01 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0322  general secretion pathway protein K  30.38 
 
 
334 aa  90.1  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4244  general secretion pathway protein K  28.48 
 
 
318 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.903399  normal  0.0684356 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1039  general secretion pathway protein K  26.82 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1083  general secretion pathway protein K  28.52 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1042  general secretion pathway protein K  28.52 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4184  general secretion pathway protein K  27.49 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1011  general secretion pathway protein K  22.25 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0959  general secretion pathway protein K  21.57 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3263  general secretion pathway protein K  21.45 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000006292  hitchhiker  0.00000000000000735036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0257  general secretion pathway protein K  23.34 
 
 
320 aa  67  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.632312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1894  general secretion pathway protein K  26.4 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3525  general secretion pathway protein K  24.36 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0219925  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0148  General secretion pathway protein K  23.05 
 
 
315 aa  63.5  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0235  General secretion pathway protein K  27.52 
 
 
265 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3132  general secretion pathway protein K  24.63 
 
 
332 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.897266  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0073  general secretion pathway protein K  22.76 
 
 
369 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0016  general secretion pathway protein K  22.76 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00504309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0054  general secretion pathway protein K  22.76 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117159  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0757  general secretion pathway protein K  24.65 
 
 
294 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.408442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0055  general secretion pathway protein K  23.48 
 
 
374 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2386  general secretion pathway protein K  26.19 
 
 
272 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000100427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3423  general secretion pathway protein K  24.43 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000677151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1527  general secretion pathway protein K  23.82 
 
 
357 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153485  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0552  General secretion pathway protein K  33.33 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0044  general secretion pathway protein K  21.76 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0054  general secretion pathway protein K  21.76 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350854  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0862  general secretory pathway protein K  32.06 
 
 
281 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00384723  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0322  general secretion pathway protein K  35.97 
 
 
306 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3371  general secretion pathway protein K  35.19 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.394857 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2777  general secretory pathway protein K  23.95 
 
 
372 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0228  general secretion pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.407929  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0015  general secretion pathway protein K  22.89 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55480  putative type II secretion system protein  25.21 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3510  general secretory pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1882  general secretory pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0016  general secretion pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0016  general secretion pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.252749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2670  general secretory pathway protein K  23.95 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0612709  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0775  general secretion pathway protein K  33.33 
 
 
281 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.148294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3944  General secretion pathway protein K  22.89 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3178  general secretion pathway protein K  31.71 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.48271  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02682  general secretion pathway protein K  37.04 
 
 
283 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1120  general secretion pathway protein K  24.16 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3225  general secretion pathway protein K  22.06 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0676  general secretion pathway protein K  21.4 
 
 
301 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3236  general secretion pathway protein K  22.25 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265565  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0588  General secretion pathway protein K  25.23 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1077  general secretion pathway protein K  23.2 
 
 
333 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3388  general secretion pathway protein K  23.65 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5693  general secretion pathway protein K  35.9 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.144988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3395  General secretion pathway protein K  29.77 
 
 
362 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2536  General secretion pathway protein K  29.46 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.109857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0601  General secretion pathway protein K  23.99 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000025238 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1274  General secretion pathway protein K  33.9 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>