More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1299 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  61.09 
 
 		 655 aa  825    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 716 aa  1445    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  48.58 
 
 		 650 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  48.43 
 
 		 654 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  48.43 
 
 		 654 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  45.03 
 
 		 675 aa  592  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  45.6 
 
 		 662 aa  578  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  45.6 
 
 		 710 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  45.02 
 
 		 658 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  45.96 
 
 		 674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  45.09 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  45.09 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  45.09 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  45.08 
 
 		 672 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  46.22 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  45.29 
 
 		 703 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  45.17 
 
 		 704 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  45.18 
 
 		 706 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  45.97 
 
 		 700 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3619  general secretion pathway protein D  46.09 
 
 		 707 aa  561  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0440074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  45.97 
 
 		 700 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  45.57 
 
 		 705 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  45.3 
 
 		 702 aa  556  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  46.06 
 
 		 704 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  45.58 
 
 		 703 aa  554  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  45.07 
 
 		 681 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  43.17 
 
 		 697 aa  549  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  44.79 
 
 		 689 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  89.42 
 
 		 714 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  72.5 
 
 		 640 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  42.67 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  42.67 
 
 		 686 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  42.53 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  42.53 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  42.59 
 
 		 686 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  70.83 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  40.17 
 
 		 660 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  40.34 
 
 		 696 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  33.53 
 
 		 673 aa  349  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  33.38 
 
 		 670 aa  339  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  57.93 
 
 		 724 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  55.93 
 
 		 705 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  56.46 
 
 		 714 aa  323  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  53.98 
 
 		 705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  36.13 
 
 		 717 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  32.42 
 
 		 703 aa  302  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  32.75 
 
 		 789 aa  302  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  32.13 
 
 		 658 aa  299  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  31.46 
 
 		 658 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  32.62 
 
 		 757 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  32.62 
 
 		 757 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  33.18 
 
 		 791 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  32.62 
 
 		 757 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  32.47 
 
 		 750 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  33.19 
 
 		 744 aa  289  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  32.62 
 
 		 757 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  32.47 
 
 		 757 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  32.47 
 
 		 757 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  33.03 
 
 		 791 aa  287  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  32.72 
 
 		 771 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  32.86 
 
 		 777 aa  286  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  32.67 
 
 		 814 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  32.41 
 
 		 787 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  33.68 
 
 		 725 aa  283  8.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  32.38 
 
 		 780 aa  283  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  32.91 
 
 		 787 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  34.16 
 
 		 791 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  32.95 
 
 		 805 aa  279  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  31.87 
 
 		 783 aa  278  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  32.38 
 
 		 774 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  32.38 
 
 		 774 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  31.31 
 
 		 645 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  34.1 
 
 		 807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  31.95 
 
 		 750 aa  276  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  32.16 
 
 		 650 aa  273  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  32.27 
 
 		 783 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  32.35 
 
 		 736 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  33.08 
 
 		 793 aa  270  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  33.48 
 
 		 803 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  31.99 
 
 		 738 aa  265  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  30.54 
 
 		 776 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  31.34 
 
 		 682 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  31.48 
 
 		 728 aa  264  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  31.73 
 
 		 748 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  31.35 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  30.47 
 
 		 803 aa  257  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  30.88 
 
 		 753 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  30.42 
 
 		 748 aa  250  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  30.41 
 
 		 747 aa  250  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  29.52 
 
 		 758 aa  249  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  31.69 
 
 		 781 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  31.55 
 
 		 781 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.72 
 
 		 641 aa  239  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  30.42 
 
 		 804 aa  238  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  31.24 
 
 		 740 aa  236  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  30.3 
 
 		 634 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  31.26 
 
 		 774 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  33.75 
 
 		 655 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0315  type II and III secretion system protein  29.57 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.713775 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  28.08 
 
 		 648 aa  227  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>