More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1155 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 76 aa  155  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  97.37 
 
 		 76 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  69.44 
 
 		 72 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2573  transcriptional regulator, XRE family  69.44 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  42.86 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 		 70 aa  70.1  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5795  putative transcription regulator  46.97 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.372775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  55.93 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  41.43 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3421  transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  42.03 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 71 aa  63.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1019  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  48.33 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2521  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  47.89 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0107  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1892  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0261519  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3149  putative transcription regulator protein  45.16 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.369647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1097  transcription regulator protein  44.12 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2294  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.33 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00599682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  42.42 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0198  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3227  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.792428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1921  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.339052  normal  0.010603 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0252  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3201  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000878656  hitchhiker  0.0000000379296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  54 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2403  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 333 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  41.94 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4180  XRE family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 199 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4719  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 86 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.155246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3368  DNA-binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00271776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2009  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.634386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3132  putative transcription regulator protein  41.18 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.25062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1219  putative HTH-type transcriptional regulator  41.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.568152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  42.62 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3995  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1957  transcriptional regulator, XRE family  43.66 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0995  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.651052 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3066  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0121825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4019  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0671372 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3344  DNA-binding protein  34.43 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0433  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0965  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476266  normal  0.0356883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1886  DNA-binding protein  32.79 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4032  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 187 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.45676  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3025  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314698  normal  0.932142 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1799  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2458  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.282719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0577  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0127  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.116873  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2134  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 85 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123571  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>