More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0969 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88 
 
 
500 aa  889    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  87.6 
 
 
500 aa  885    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  87.6 
 
 
500 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  87.8 
 
 
500 aa  887    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  67.21 
 
 
496 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  87.6 
 
 
500 aa  885    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88 
 
 
500 aa  889    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  67.21 
 
 
496 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  61.2 
 
 
507 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  67.21 
 
 
506 aa  679    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  92.42 
 
 
501 aa  935    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  67.62 
 
 
506 aa  680    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  66.87 
 
 
503 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  100 
 
 
500 aa  1009    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  61.6 
 
 
507 aa  637    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  67.41 
 
 
496 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  88.6 
 
 
500 aa  896    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  88.2 
 
 
500 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  59.43 
 
 
516 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  59.07 
 
 
505 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  54.64 
 
 
512 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  55.08 
 
 
515 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  53.31 
 
 
504 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.39 
 
 
501 aa  511  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  51.12 
 
 
523 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  50.8 
 
 
499 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 
503 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  50.3 
 
 
510 aa  504  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  50.4 
 
 
499 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  50.81 
 
 
500 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  50.81 
 
 
499 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  50.81 
 
 
499 aa  498  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  50.5 
 
 
526 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  47.91 
 
 
507 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  50.31 
 
 
506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.49 
 
 
522 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  50.2 
 
 
516 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.23 
 
 
513 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  50.84 
 
 
525 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  52.27 
 
 
511 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  50.84 
 
 
525 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  51.5 
 
 
505 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  50.74 
 
 
504 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  49.69 
 
 
504 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  50.74 
 
 
504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  49.9 
 
 
504 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  50.74 
 
 
504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  48.9 
 
 
503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  49.08 
 
 
549 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  48.1 
 
 
529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  45.86 
 
 
544 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  50.83 
 
 
502 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  45.45 
 
 
544 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  47.17 
 
 
497 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.34 
 
 
508 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.19 
 
 
519 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.58 
 
 
499 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.12 
 
 
501 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.94 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  44.35 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.33 
 
 
512 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.33 
 
 
512 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.9 
 
 
513 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.9 
 
 
514 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  42.62 
 
 
496 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
504 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 
512 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.68 
 
 
513 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
496 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
496 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
497 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.76 
 
 
525 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44 
 
 
506 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.79 
 
 
494 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.2 
 
 
500 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  41.84 
 
 
585 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  43.8 
 
 
506 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  42.41 
 
 
506 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 
526 aa  384  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.42 
 
 
505 aa  385  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  42.61 
 
 
512 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  44.49 
 
 
506 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.82 
 
 
508 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  42.07 
 
 
504 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  44.09 
 
 
528 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.77 
 
 
514 aa  380  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  43.49 
 
 
501 aa  382  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0501  ABC transporter related  42.86 
 
 
511 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  41.77 
 
 
495 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  42.65 
 
 
525 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
518 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3548  ABC transporter related  44.09 
 
 
506 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4819  ABC transporter related  44.09 
 
 
506 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0757413  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  42.31 
 
 
501 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5464  ABC transporter related  44.09 
 
 
506 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.146779 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.79 
 
 
513 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.26 
 
 
501 aa  375  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.28 
 
 
514 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.3 
 
 
494 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.05 
 
 
524 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>